24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0988 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0988  IS1327 transposase  100 
 
 		 56 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 238 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  82.14 
 
 		 238 aa  93.6  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  54.9 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  66.67 
 
 		 263 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  66.67 
 
 		 341 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  86.67 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2617  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  45.1 
 
 		 215 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  43.9 
 
 		 235 aa  44.7  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0568  transposase  45.45 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.084687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  43.9 
 
 		 302 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  43.9 
 
 		 235 aa  42.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  43.9 
 
 		 235 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  50 
 
 		 254 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  50 
 
 		 254 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  39.02 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  41.3 
 
 		 218 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0209  hypothetical protein  39.02 
 
 		 262 aa  40.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2344  transposase, truncated  39.58 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2482  transposase  39.58 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527484  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1612  transposase, truncated  39.58 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1758  transposase, truncated  39.58 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>