189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2583 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2583  putative insertion sequence transposase-like protein  100 
 
 
79 aa  163  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  85.53 
 
 
259 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  80.52 
 
 
224 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  75.32 
 
 
346 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  76 
 
 
224 aa  130  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  75.32 
 
 
250 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  75.32 
 
 
250 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  71.79 
 
 
346 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  71.79 
 
 
250 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  70.13 
 
 
250 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  68.83 
 
 
227 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  68.83 
 
 
250 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  65.38 
 
 
319 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  67.53 
 
 
250 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  67.53 
 
 
250 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  68.83 
 
 
250 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  64.1 
 
 
250 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  66.23 
 
 
246 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  63.64 
 
 
250 aa  103  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  63.64 
 
 
234 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  59.74 
 
 
250 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8268  hypothetical protein  61.76 
 
 
98 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0489738  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  59.02 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  59.02 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  59.02 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  58.06 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  57.38 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  52.38 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  52.38 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  52.38 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  53.23 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  53.23 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  53.23 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0568  transposase  53.23 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.084687  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  53.23 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  53.23 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  53.23 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  53.23 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  53.23 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  53.23 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  53.23 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  53.23 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  53.23 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  53.23 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  53.23 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  53.23 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  53.23 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  53.23 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  53.23 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  53.23 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  53.23 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  53.23 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  53.23 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  53.23 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  53.23 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  53.23 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  55.36 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  50.82 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  53.33 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  46.03 
 
 
228 aa  70.1  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2566  putative transposase  49.18 
 
 
64 aa  70.5  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00978808  hitchhiker  0.00000650323 
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  46.03 
 
 
228 aa  70.1  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  46.03 
 
 
228 aa  70.1  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  50 
 
 
227 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  46.67 
 
 
235 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  45 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  42.86 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  48.33 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  45 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  45 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44.44 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  48.33 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  44.44 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0553  hypothetical protein  75 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152843  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44.44 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  44.44 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  43.33 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  46.67 
 
 
235 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  46.55 
 
 
236 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  42.62 
 
 
246 aa  62  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0209  hypothetical protein  45 
 
 
262 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  45 
 
 
235 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1015  transposase  44.83 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.653024  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8176  hypothetical protein  56 
 
 
75 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532624  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6479  hypothetical protein  59.32 
 
 
74 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  42.62 
 
 
262 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  40.35 
 
 
226 aa  60.1  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  44.64 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  43.86 
 
 
236 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  45 
 
 
235 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  44.64 
 
 
211 aa  59.3  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  44.64 
 
 
236 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  44.64 
 
 
237 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  42.11 
 
 
226 aa  58.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  42.11 
 
 
226 aa  58.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  42.11 
 
 
226 aa  58.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  44.64 
 
 
237 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  42.62 
 
 
236 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  43.64 
 
 
226 aa  57.4  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1565  hypothetical protein  56.52 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.276056 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>