239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3878 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3878  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
257 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.225948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4686  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.6 
 
 
257 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2609  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.32 
 
 
254 aa  334  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0258596  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2637  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.72 
 
 
255 aa  328  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.928924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2969  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.87 
 
 
254 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920046  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2648  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.92 
 
 
254 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0453351  normal  0.0112314 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1921  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.57 
 
 
270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0516  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.92 
 
 
248 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0994  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.34 
 
 
259 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2444  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.2 
 
 
260 aa  301  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2871  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.31 
 
 
265 aa  297  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0175747 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1573  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.7 
 
 
247 aa  297  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.313613  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0196  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.67 
 
 
254 aa  295  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.64 
 
 
249 aa  291  9e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0911  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.11 
 
 
247 aa  290  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0316197  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2563  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.37 
 
 
252 aa  290  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117328  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2254  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.84 
 
 
256 aa  289  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339029  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1854  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.67 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0422  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.79 
 
 
244 aa  285  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.644654  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.53 
 
 
251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.373723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1672  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.2 
 
 
252 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0305  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.2 
 
 
252 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2629  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.49 
 
 
241 aa  276  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.39 
 
 
242 aa  275  6e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.86 
 
 
249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.0399553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2574  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.27 
 
 
249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0294223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2271  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.86 
 
 
249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.10527 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1407  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.98 
 
 
248 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2229  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.08 
 
 
249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.604387  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7366  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.94 
 
 
252 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00681415  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3873  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.16 
 
 
241 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.532548  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  55.92 
 
 
243 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.65 
 
 
243 aa  258  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.65 
 
 
247 aa  255  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.79 
 
 
243 aa  256  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  56.22 
 
 
243 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  56.22 
 
 
243 aa  255  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  56.22 
 
 
243 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.22 
 
 
243 aa  255  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.22 
 
 
243 aa  255  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.22 
 
 
243 aa  255  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.22 
 
 
243 aa  255  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.88 
 
 
243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.22 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.22 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.22 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.22 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.06 
 
 
243 aa  251  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.94 
 
 
243 aa  251  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.74 
 
 
243 aa  251  1e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.17 
 
 
243 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.17 
 
 
243 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.17 
 
 
243 aa  250  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.79 
 
 
243 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  54.51 
 
 
243 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  53.33 
 
 
250 aa  249  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.83 
 
 
243 aa  248  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.25 
 
 
245 aa  248  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4119  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.85 
 
 
246 aa  248  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.94 
 
 
243 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.92 
 
 
243 aa  245  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6617  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.94 
 
 
252 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03404  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.63 
 
 
250 aa  244  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405613  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.65 
 
 
243 aa  241  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.65 
 
 
243 aa  238  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1057  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.91 
 
 
245 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.87 
 
 
254 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147174  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.28 
 
 
270 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.64 
 
 
265 aa  235  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1944  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  50 
 
 
255 aa  234  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.35633  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.59 
 
 
240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.02 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1013  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2526  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.52 
 
 
239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.39 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1017  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.41 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.07 
 
 
264 aa  233  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2167  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.8 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761233  normal  0.284873 
 
 
-
 
NC_002978  WD0064  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.06 
 
 
235 aa  232  5e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.757519  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0883  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.89 
 
 
245 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.346326 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0370  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.65 
 
 
264 aa  231  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225374  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.89 
 
 
260 aa  230  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4249  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52 
 
 
258 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.58 
 
 
240 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2892  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.87 
 
 
257 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2333  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.44 
 
 
242 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2837  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.87 
 
 
257 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.16 
 
 
244 aa  229  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.33 
 
 
248 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.87 
 
 
257 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.795821  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0795  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.49 
 
 
246 aa  229  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1786  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.87 
 
 
257 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2818  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.87 
 
 
257 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2463  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.87 
 
 
257 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1040  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.24 
 
 
245 aa  228  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.526796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.94 
 
 
248 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.85 
 
 
248 aa  228  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0109345  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1350  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.46 
 
 
261 aa  228  7e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0751637  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.87 
 
 
257 aa  228  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>