239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4686 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4686  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2609  pyridoxine 5'-phosphate synthase  79.52 
 
 
254 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0258596  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2969  pyridoxine 5'-phosphate synthase  79.35 
 
 
254 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.920046  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2254  pyridoxine 5'-phosphate synthase  80.57 
 
 
256 aa  380  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339029  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2637  pyridoxine 5'-phosphate synthase  79.84 
 
 
255 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.928924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1921  pyridoxine 5'-phosphate synthase  81.07 
 
 
270 aa  371  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2648  pyridoxine 5'-phosphate synthase  80.32 
 
 
254 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0453351  normal  0.0112314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2444  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.08 
 
 
260 aa  318  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0994  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.39 
 
 
259 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0516  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.84 
 
 
248 aa  308  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3878  pyridoxine 5'-phosphate synthase  73.8 
 
 
257 aa  298  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.225948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2871  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.2 
 
 
265 aa  297  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0175747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0911  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.55 
 
 
247 aa  297  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0316197  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0196  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.81 
 
 
254 aa  295  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.37 
 
 
249 aa  294  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1407  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.75 
 
 
248 aa  292  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.46 
 
 
251 aa  290  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.373723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3873  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.2 
 
 
241 aa  289  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.532548  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1573  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.43 
 
 
247 aa  286  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.313613  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2271  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.79 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.10527 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2563  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.75 
 
 
252 aa  281  9e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117328  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2229  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.23 
 
 
249 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.604387  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.73 
 
 
242 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.38 
 
 
249 aa  279  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.0399553 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2629  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.89 
 
 
241 aa  275  6e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1854  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.18 
 
 
249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0305  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.7 
 
 
252 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1672  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.7 
 
 
252 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0422  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.26 
 
 
244 aa  263  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.644654  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.38 
 
 
243 aa  260  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2574  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.26 
 
 
249 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0294223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7366  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.31 
 
 
252 aa  258  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00681415  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  55.14 
 
 
243 aa  256  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  55.14 
 
 
243 aa  256  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.14 
 
 
243 aa  256  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  55.14 
 
 
243 aa  256  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.14 
 
 
243 aa  256  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.14 
 
 
243 aa  256  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.14 
 
 
243 aa  256  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.14 
 
 
243 aa  256  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.85 
 
 
245 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.56 
 
 
243 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.56 
 
 
243 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.56 
 
 
243 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.56 
 
 
243 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.73 
 
 
243 aa  254  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.23 
 
 
270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4119  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.88 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.3 
 
 
243 aa  252  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  54.17 
 
 
250 aa  252  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.14 
 
 
243 aa  251  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.63 
 
 
243 aa  251  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  55.56 
 
 
243 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.7 
 
 
251 aa  251  9.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.13 
 
 
243 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0795  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.77 
 
 
246 aa  249  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.07 
 
 
243 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.14 
 
 
254 aa  248  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147174  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.19 
 
 
240 aa  248  6e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.96 
 
 
243 aa  248  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.96 
 
 
243 aa  247  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.96 
 
 
243 aa  247  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.91 
 
 
243 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  53.91 
 
 
243 aa  246  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.5 
 
 
243 aa  245  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.24 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.96 
 
 
260 aa  241  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.04 
 
 
243 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.02 
 
 
265 aa  241  9e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.13 
 
 
247 aa  240  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03404  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.36 
 
 
250 aa  240  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405613  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1350  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.14 
 
 
261 aa  239  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0751637  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0064  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.08 
 
 
235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.757519  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.1 
 
 
248 aa  238  5.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.81 
 
 
248 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.03 
 
 
248 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6617  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.55 
 
 
252 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.05 
 
 
244 aa  236  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.67 
 
 
254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.14 
 
 
246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.51 
 
 
248 aa  234  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.14 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1095  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.79 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.533412  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2167  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.97 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761233  normal  0.284873 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.14 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1013  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.56 
 
 
258 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1040  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.69 
 
 
245 aa  232  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.526796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1057  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.69 
 
 
245 aa  233  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.24 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1088  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.26 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1017  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.56 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1944  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  50.6 
 
 
255 aa  231  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.35633  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1246  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.09 
 
 
245 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000778837  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.03 
 
 
248 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.97 
 
 
257 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.795821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2892  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.97 
 
 
257 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2818  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.97 
 
 
257 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1786  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.97 
 
 
257 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2463  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.97 
 
 
257 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2837  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.97 
 
 
257 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>