More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0392 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  62.21 
 
 
554 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0392  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
525 aa  1025    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  69.64 
 
 
521 aa  634  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  69.25 
 
 
521 aa  632  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  61.85 
 
 
541 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  57.63 
 
 
548 aa  554  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  53.6 
 
 
521 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  54.25 
 
 
549 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  55.6 
 
 
514 aa  477  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  45.91 
 
 
553 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  44.98 
 
 
533 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  35.56 
 
 
605 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  36.47 
 
 
561 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  35.34 
 
 
567 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  33.46 
 
 
565 aa  221  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  35.14 
 
 
569 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  36.67 
 
 
564 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  35.37 
 
 
573 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  37.13 
 
 
588 aa  216  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  36.47 
 
 
564 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  32.6 
 
 
562 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  36.51 
 
 
588 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  35.73 
 
 
593 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  36.51 
 
 
588 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  36.38 
 
 
564 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  33.97 
 
 
562 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  34 
 
 
590 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  35.35 
 
 
589 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  35.35 
 
 
589 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  35.35 
 
 
572 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  35.2 
 
 
589 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  35.35 
 
 
572 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  35.35 
 
 
572 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  35.35 
 
 
572 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  35.35 
 
 
560 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  30.89 
 
 
502 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  33.67 
 
 
569 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  34.14 
 
 
479 aa  194  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  36.04 
 
 
518 aa  187  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  29.94 
 
 
475 aa  176  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 
483 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  30.18 
 
 
488 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  29.58 
 
 
487 aa  154  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  34.38 
 
 
480 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  27.84 
 
 
487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  30.12 
 
 
484 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  29.42 
 
 
483 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  29.77 
 
 
484 aa  152  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  28.74 
 
 
484 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 
474 aa  150  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  28.07 
 
 
484 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  29.9 
 
 
488 aa  143  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  27.93 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  35.16 
 
 
500 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  29.85 
 
 
487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  28.23 
 
 
481 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  29.92 
 
 
487 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  29.92 
 
 
487 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  29.92 
 
 
487 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  29.92 
 
 
487 aa  137  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  29.92 
 
 
487 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  29.92 
 
 
487 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  29.92 
 
 
487 aa  137  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  35.48 
 
 
486 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  30.89 
 
 
566 aa  136  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  31.36 
 
 
481 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  29.62 
 
 
487 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  29.71 
 
 
487 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  31.01 
 
 
477 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  29.96 
 
 
487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  29.96 
 
 
487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  30.9 
 
 
477 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  29.76 
 
 
487 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  29.76 
 
 
487 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  29.76 
 
 
487 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  28.37 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  31.2 
 
 
477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  33.58 
 
 
485 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  30.35 
 
 
477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  28.87 
 
 
487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  32.72 
 
 
533 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000622653  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02491  protease  34.69 
 
 
533 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  30.62 
 
 
478 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  31.65 
 
 
268 aa  127  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  29.26 
 
 
487 aa  127  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  29.75 
 
 
477 aa  127  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  29.96 
 
 
494 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  25.66 
 
 
494 aa  126  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  33.82 
 
 
486 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  32.88 
 
 
268 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  29.47 
 
 
487 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  28.49 
 
 
503 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  29.75 
 
 
524 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  30.85 
 
 
561 aa  123  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  35.81 
 
 
278 aa  123  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  30.68 
 
 
553 aa  123  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  29.75 
 
 
494 aa  123  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  26.75 
 
 
489 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  26.75 
 
 
489 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  26.75 
 
 
489 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>