More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0238 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0238  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 
374 aa  758    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2957  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51.13 
 
 
364 aa  359  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2722  putative alpha-methylacyl-CoA racemase  41.72 
 
 
389 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1532  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.44 
 
 
390 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.805397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2037  Alpha-methylacyl-CoA racemase  39.22 
 
 
350 aa  235  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.180097  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1622  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.85 
 
 
391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1248  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.82 
 
 
368 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.450925  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1527  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.85 
 
 
391 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1375  putative racemase transmembrane protein  40.27 
 
 
368 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0625806  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2342  Alpha-methylacyl-CoA racemase  39.78 
 
 
391 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2969  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.17 
 
 
393 aa  229  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0453018  normal  0.0946955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1663  Alpha-methylacyl-CoA racemase  39.95 
 
 
377 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655782  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49070  hypothetical protein  39.43 
 
 
393 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000016893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1314  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.55 
 
 
368 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4191  hypothetical protein  40.96 
 
 
393 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4235  Alpha-methylacyl-CoA racemase  41.43 
 
 
393 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3575  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.84 
 
 
389 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1527  Alpha-methylacyl-CoA racemase  35.44 
 
 
391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.351028  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2474  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.72 
 
 
437 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000208733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3358  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.94 
 
 
396 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2199  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.74 
 
 
401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1550  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.51 
 
 
383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1356  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.79 
 
 
362 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0359524  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5761  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.59 
 
 
393 aa  209  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2597  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.75 
 
 
367 aa  203  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.279843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1227  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.32 
 
 
359 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7154  hypothetical protein  34.86 
 
 
377 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  decreased coverage  0.00611319 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3010  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.37 
 
 
397 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1554  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.69 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0668  CAIB/BAIF family protein  34.48 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2713  Alpha-methylacyl-CoA racemase  36.89 
 
 
386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2089  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.86 
 
 
363 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0891  hypothetical protein  37.58 
 
 
388 aa  196  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6474  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.37 
 
 
409 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1329  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.81 
 
 
423 aa  192  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.94269  normal  0.646992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2231  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.99 
 
 
384 aa  192  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4578  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.73 
 
 
364 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4126  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.22 
 
 
381 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3880  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.11 
 
 
400 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96055  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11166  alpha-methylacyl-CoA racemase mcr  34.07 
 
 
395 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.151416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1540  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.37 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2126  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.43 
 
 
364 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1859  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.32 
 
 
384 aa  189  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000680398  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7493  Alpha-methylacyl-CoA racemase  33.24 
 
 
384 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1043  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.67 
 
 
386 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.129255 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2107  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.2 
 
 
357 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0309  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.81 
 
 
355 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4552  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.43 
 
 
388 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1959  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.85 
 
 
369 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166829  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4298  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.94 
 
 
363 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4167  Alpha-methylacyl-CoA racemase  34.25 
 
 
387 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4144  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.94 
 
 
363 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4069  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.94 
 
 
363 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1808  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.94 
 
 
370 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3181  fatty-acyl-CoA racemase  37.57 
 
 
393 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1595  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.8 
 
 
412 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.880614  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7187  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.14 
 
 
350 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659137  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23620  predicted acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase  33.71 
 
 
358 aa  186  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.274717 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1400  CoA-transferase family III protein  34.2 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.244343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3400  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.2 
 
 
393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0361519 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1606  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.44 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3636  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.63 
 
 
367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5306  Alpha-methylacyl-CoA racemase  35.52 
 
 
365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0561712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2908  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.04 
 
 
411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0520  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.8 
 
 
353 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0933199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4571  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.77 
 
 
385 aa  182  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1599  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.08 
 
 
423 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2211  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.16 
 
 
426 aa  182  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.859864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3876  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.52 
 
 
375 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0969  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.13 
 
 
385 aa  182  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5535  Alpha-methylacyl-CoA racemase  31.86 
 
 
373 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5556  Alpha-methylacyl-CoA racemase  31.5 
 
 
369 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3918  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.75 
 
 
393 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10872  fatty-acid-CoA racemase far  33.53 
 
 
359 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0374561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0257  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.73 
 
 
392 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1603  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.65 
 
 
347 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0977519  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7292  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.34 
 
 
388 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5109  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.72 
 
 
383 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7158  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.03 
 
 
386 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3187  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.27 
 
 
395 aa  179  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0034  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35 
 
 
409 aa  179  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3255  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.87 
 
 
340 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449136  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.46 
 
 
395 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0812  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.93 
 
 
379 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3898  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.76 
 
 
380 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2372  Alpha-methylacyl-CoA racemase  35.35 
 
 
364 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216792  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5525  Alpha-methylacyl-CoA racemase  33.82 
 
 
378 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1483  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.99 
 
 
363 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.166224  normal  0.574161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3539  Alpha-methylacyl-CoA racemase  35.54 
 
 
368 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.634398  normal  0.106078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3441  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.06 
 
 
364 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5357  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.34 
 
 
464 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203757  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2645  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.77 
 
 
388 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1886  Alpha-methylacyl-CoA racemase  35.54 
 
 
384 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.494704 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0683  Formyl-CoA transferase  35.57 
 
 
416 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521571  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2948  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.88 
 
 
387 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2707  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.79 
 
 
375 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497661  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.71 
 
 
416 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4036  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.99 
 
 
376 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.472994  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0399  putative fatty acid-CoA racemase  36.06 
 
 
372 aa  176  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3088  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.17 
 
 
376 aa  176  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.135357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>