More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3358 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3358  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 
396 aa  785    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1314  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  54.39 
 
 
368 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5761  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  54.81 
 
 
393 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1248  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  54.96 
 
 
368 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.450925  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1375  putative racemase transmembrane protein  56.03 
 
 
368 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0625806  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1663  Alpha-methylacyl-CoA racemase  51.87 
 
 
377 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655782  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2474  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  52.34 
 
 
437 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000208733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1527  Alpha-methylacyl-CoA racemase  45.55 
 
 
391 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.351028  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1356  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  51.04 
 
 
362 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0359524  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1527  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.83 
 
 
391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1622  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  47.83 
 
 
391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1532  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  48.08 
 
 
390 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.805397 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2342  Alpha-methylacyl-CoA racemase  50.9 
 
 
391 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359975  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1595  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  46.63 
 
 
412 aa  286  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.880614  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1554  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.71 
 
 
382 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49070  hypothetical protein  42.28 
 
 
393 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000016893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0668  CAIB/BAIF family protein  37.73 
 
 
388 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6474  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  50.15 
 
 
409 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4191  hypothetical protein  41.79 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2037  Alpha-methylacyl-CoA racemase  45.81 
 
 
350 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.180097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4235  Alpha-methylacyl-CoA racemase  41.88 
 
 
393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2969  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.25 
 
 
393 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0453018  normal  0.0946955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2722  putative alpha-methylacyl-CoA racemase  38.87 
 
 
389 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3010  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  45.91 
 
 
397 aa  260  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7154  hypothetical protein  41.43 
 
 
377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  decreased coverage  0.00611319 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7187  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.99 
 
 
350 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659137  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5437  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.56 
 
 
377 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1859  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.62 
 
 
384 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000680398  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2456  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.71 
 
 
408 aa  243  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2199  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.64 
 
 
401 aa  242  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4521  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.41 
 
 
389 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461003  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3880  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.05 
 
 
400 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96055  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1540  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.02 
 
 
352 aa  241  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5535  Alpha-methylacyl-CoA racemase  37.53 
 
 
373 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3876  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.78 
 
 
375 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1400  CoA-transferase family III protein  39.52 
 
 
353 aa  239  8e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.244343 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1227  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.78 
 
 
359 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2372  Alpha-methylacyl-CoA racemase  42.7 
 
 
364 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216792  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4571  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.9 
 
 
385 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0309  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.03 
 
 
355 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5019  Alpha-methylacyl-CoA racemase  40 
 
 
388 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.116039  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3088  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.03 
 
 
376 aa  236  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.135357 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6417  Formyl-CoA transferase  38.75 
 
 
418 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478883  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6129  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39 
 
 
418 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3441  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.04 
 
 
364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3898  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.26 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2713  Alpha-methylacyl-CoA racemase  36.1 
 
 
386 aa  233  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5525  Alpha-methylacyl-CoA racemase  36.53 
 
 
378 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4167  Alpha-methylacyl-CoA racemase  38.4 
 
 
387 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2729  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.69 
 
 
395 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5665  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.26 
 
 
373 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3539  Alpha-methylacyl-CoA racemase  43.19 
 
 
368 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.634398  normal  0.106078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2045  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.39 
 
 
355 aa  229  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3575  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.73 
 
 
389 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3181  fatty-acyl-CoA racemase  42.23 
 
 
393 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0626  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.21 
 
 
383 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4552  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.78 
 
 
388 aa  227  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2731  Alpha-methylacyl-CoA racemase  40.05 
 
 
389 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1043  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.85 
 
 
386 aa  227  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.129255 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7493  Alpha-methylacyl-CoA racemase  37.27 
 
 
384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1184  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.12 
 
 
356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0288  alpha-methylacyl-CoA racemase  40.78 
 
 
377 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0064  alpha-methylacyl-CoA racemase  41.15 
 
 
377 aa  225  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0075  CAIB/BAIF family protein  40.78 
 
 
377 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1821  amacr protein  40.78 
 
 
431 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.866292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23620  predicted acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase  40.75 
 
 
358 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.274717 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3486  alpha-methylacyl-CoA racemase  40.78 
 
 
377 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2731  alpha-methylacyl-CoA racemase  40.78 
 
 
377 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0076  alpha-methylacyl-CoA racemase  40.78 
 
 
377 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7292  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.46 
 
 
388 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8312  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.05 
 
 
425 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0250341  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3775  Alpha-methylacyl-CoA racemase  37.81 
 
 
370 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2231  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.1 
 
 
384 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2957  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.81 
 
 
364 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5227  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  43.14 
 
 
364 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.012301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1734  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.79 
 
 
368 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5306  Alpha-methylacyl-CoA racemase  41.16 
 
 
365 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0561712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3918  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.71 
 
 
393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5435  Alpha-methylacyl-CoA racemase  40 
 
 
370 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512968  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5556  Alpha-methylacyl-CoA racemase  37.85 
 
 
369 aa  222  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4160  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.11 
 
 
407 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0969  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  41.74 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4578  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.48 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2211  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.41 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.859864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1959  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.17 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166829  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0282  Alpha-methylacyl-CoA racemase  37.66 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2107  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.31 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2707  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.87 
 
 
375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497661  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1550  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.89 
 
 
383 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2908  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.78 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0238  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.52 
 
 
374 aa  220  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.68 
 
 
395 aa  219  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6900  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.08 
 
 
395 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1483  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.57 
 
 
363 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.166224  normal  0.574161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2089  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  40.74 
 
 
363 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3255  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  42.12 
 
 
340 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449136  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  39.2 
 
 
395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0399  putative fatty acid-CoA racemase  39.36 
 
 
372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0891  hypothetical protein  36.36 
 
 
388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.09 
 
 
419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>