More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01084 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2559  amino acid carrier protein  71.65 
 
 		 509 aa  699    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01084  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1031    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1002  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  85.34 
 
 		 500 aa  848    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004327  sodium/alanine symporter  96.12 
 
 		 515 aa  1003    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1909  amino acid carrier protein  64.89 
 
 		 507 aa  681    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5793  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0312  sodium/alanine symporter  87.38 
 
 		 516 aa  906    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0452  amino acid carrier protein  62.55 
 
 		 516 aa  624  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0597  amino acid carrier protein  61.71 
 
 		 515 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1484  amino acid carrier protein  59.45 
 
 		 494 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1431  amino acid carrier protein  59.03 
 
 		 495 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1496  amino acid carrier protein  58.83 
 
 		 495 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0617  amino acid carrier protein  59.49 
 
 		 495 aa  586  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0096  Sodium/alanine symporter  60.15 
 
 		 496 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0706  sodium/alanine symporter family protein  59.52 
 
 		 486 aa  578  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3063  sodium:alanine symporter family protein  60.4 
 
 		 495 aa  581  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0549  sodium/alanine symporter family protein  59.52 
 
 		 486 aa  578  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0549  sodium/alanine symporter family protein  59.32 
 
 		 486 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4664  sodium/alanine symporter family protein  59.32 
 
 		 487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.36209e-20 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0411  amino acid carrier protein  58.97 
 
 		 493 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0605  sodium/alanine symporter family protein  59.24 
 
 		 486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0638  sodium/alanine symporter family protein  59.24 
 
 		 486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0767  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  58.92 
 
 		 487 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0673  sodium/alanine symporter family protein  58.72 
 
 		 487 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0539  amino acid carrier protein  58.2 
 
 		 486 aa  568  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0377619  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0770  amino acid carrier protein  60.12 
 
 		 484 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0551  amino acid carrier protein  59.2 
 
 		 486 aa  543  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1231  amino acid carrier protein  54.74 
 
 		 489 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0620  amino acid carrier protein  52.43 
 
 		 475 aa  502  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1843  amino acid carrier protein  53.67 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1909  amino acid carrier protein  53.67 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1862  amino acid carrier protein  53.67 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3201  amino acid carrier protein  54.58 
 
 		 505 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4266  amino acid carrier protein  50.56 
 
 		 517 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2093  amino acid carrier protein  50.66 
 
 		 517 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2633  amino acid carrier protein  51.27 
 
 		 496 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2639  sodium/alanine symporter family protein  51.66 
 
 		 496 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.658687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2590  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  50.58 
 
 		 496 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2555  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  51.46 
 
 		 496 aa  488  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2836  sodium/alanine symporter family protein  51.66 
 
 		 496 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278121 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2830  sodium/alanine symporter family protein  51.66 
 
 		 496 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.703902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3198  amino acid carrier protein  51 
 
 		 483 aa  488  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2881  sodium/alanine symporter family protein  50.58 
 
 		 496 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2859  sodium/alanine symporter family protein  50.78 
 
 		 496 aa  478  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28610  amino acid carrier protein  49.63 
 
 		 526 aa  472  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2451  sodium/alanine symporter family protein  51.37 
 
 		 496 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2842  sodium/alanine symporter family protein  51.66 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.468902  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1030  amino acid carrier protein  48.41 
 
 		 522 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.773393  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1011  amino acid carrier protein  48.41 
 
 		 522 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.56383  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02700  amino acid carrier protein  48.79 
 
 		 520 aa  432  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.317976  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1215  amino acid carrier protein  45.22 
 
 		 482 aa  429  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0694  sodium/alanine symporter family protein  59.95 
 
 		 385 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4112  amino acid carrier protein  49.25 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  42.03 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  40.6 
 
 		 479 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  40.6 
 
 		 479 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  40.6 
 
 		 479 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  40.6 
 
 		 479 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  39.88 
 
 		 494 aa  360  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  40.2 
 
 		 479 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  40.16 
 
 		 480 aa  359  5e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  41.92 
 
 		 458 aa  359  5e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  40.4 
 
 		 479 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  40.4 
 
 		 479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  41.37 
 
 		 466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  40.4 
 
 		 480 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  40.12 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  40.08 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  39.64 
 
 		 481 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  40.76 
 
 		 466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1075  amino acid carrier protein  42.36 
 
 		 504 aa  349  5e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124447  hitchhiker  0.00000000000234517 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  41.96 
 
 		 493 aa  349  8e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  41.09 
 
 		 457 aa  346  5e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  39.92 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  38.66 
 
 		 476 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  40.04 
 
 		 476 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  39.76 
 
 		 485 aa  342  8e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  38.86 
 
 		 476 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  38.46 
 
 		 476 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  38.46 
 
 		 476 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  38.86 
 
 		 476 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  40.42 
 
 		 498 aa  342  1e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  40.88 
 
 		 476 aa  341  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  42.11 
 
 		 471 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  37.15 
 
 		 489 aa  341  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  40.62 
 
 		 471 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  40.5 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  38.46 
 
 		 476 aa  340  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  40.75 
 
 		 476 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  37.79 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  37.97 
 
 		 477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  37.97 
 
 		 477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  40.25 
 
 		 502 aa  337  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  37.88 
 
 		 478 aa  335  9e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0082  amino acid carrier protein  40.36 
 
 		 468 aa  335  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  39.76 
 
 		 502 aa  335  1e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3585  amino acid carrier protein  39.63 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  38.36 
 
 		 483 aa  334  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  41.58 
 
 		 474 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  37.14 
 
 		 503 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  41.61 
 
 		 470 aa  331  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>