More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3198 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3198  amino acid carrier protein  100 
 
 
483 aa  964    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4664  sodium/alanine symporter family protein  59.46 
 
 
487 aa  588  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36209e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0706  sodium/alanine symporter family protein  59.04 
 
 
486 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0549  sodium/alanine symporter family protein  58.84 
 
 
486 aa  586  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0549  sodium/alanine symporter family protein  59.04 
 
 
486 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0767  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  58.42 
 
 
487 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0673  sodium/alanine symporter family protein  58.42 
 
 
487 aa  586  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0605  sodium/alanine symporter family protein  58.63 
 
 
486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0638  sodium/alanine symporter family protein  58.63 
 
 
486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0539  amino acid carrier protein  58 
 
 
486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0377619  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0096  Sodium/alanine symporter  61.08 
 
 
496 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0551  amino acid carrier protein  58.42 
 
 
486 aa  558  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0411  amino acid carrier protein  57.08 
 
 
493 aa  555  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1431  amino acid carrier protein  56.25 
 
 
495 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1496  amino acid carrier protein  56.46 
 
 
495 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1484  amino acid carrier protein  56.67 
 
 
494 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0617  amino acid carrier protein  54.79 
 
 
495 aa  548  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3063  sodium:alanine symporter family protein  55.83 
 
 
495 aa  545  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1231  amino acid carrier protein  53.53 
 
 
489 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3201  amino acid carrier protein  51.2 
 
 
505 aa  513  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0770  amino acid carrier protein  56.76 
 
 
484 aa  510  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172723  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28610  amino acid carrier protein  52.64 
 
 
526 aa  502  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0620  amino acid carrier protein  53.73 
 
 
475 aa  499  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4266  amino acid carrier protein  51.59 
 
 
517 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176074  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1909  amino acid carrier protein  51.79 
 
 
512 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1862  amino acid carrier protein  51.79 
 
 
512 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1843  amino acid carrier protein  51.79 
 
 
512 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2093  amino acid carrier protein  53.04 
 
 
517 aa  497  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680019  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2633  amino acid carrier protein  50.31 
 
 
496 aa  495  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2639  sodium/alanine symporter family protein  49.9 
 
 
496 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.658687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2590  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  49.48 
 
 
496 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2555  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  50.1 
 
 
496 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2836  sodium/alanine symporter family protein  50.1 
 
 
496 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278121 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2830  sodium/alanine symporter family protein  49.9 
 
 
496 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.703902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2881  sodium/alanine symporter family protein  49.27 
 
 
496 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004327  sodium/alanine symporter  51.4 
 
 
515 aa  488  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01084  hypothetical protein  51 
 
 
515 aa  488  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2859  sodium/alanine symporter family protein  49.27 
 
 
496 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0312  sodium/alanine symporter  51.7 
 
 
516 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1002  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  51.7 
 
 
500 aa  481  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1215  amino acid carrier protein  49.79 
 
 
482 aa  475  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2842  sodium/alanine symporter family protein  50.1 
 
 
496 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.468902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2451  sodium/alanine symporter family protein  50.31 
 
 
496 aa  478  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0597  amino acid carrier protein  49.51 
 
 
515 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0452  amino acid carrier protein  47.73 
 
 
516 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02700  amino acid carrier protein  50.81 
 
 
520 aa  455  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.317976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1909  amino acid carrier protein  48.5 
 
 
507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5793  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2559  amino acid carrier protein  50.5 
 
 
509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1011  amino acid carrier protein  47.73 
 
 
522 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.56383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1030  amino acid carrier protein  47.73 
 
 
522 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.773393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0694  sodium/alanine symporter family protein  55.08 
 
 
385 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4112  amino acid carrier protein  49.78 
 
 
481 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  41.7 
 
 
470 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  43.37 
 
 
458 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  41.36 
 
 
485 aa  376  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  39.71 
 
 
476 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  40.08 
 
 
476 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  40.08 
 
 
476 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  40.49 
 
 
476 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  40.29 
 
 
476 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  40.46 
 
 
477 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  40 
 
 
479 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  40.29 
 
 
476 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  39.8 
 
 
479 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  40.25 
 
 
480 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  40 
 
 
479 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  40.49 
 
 
476 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  39.8 
 
 
479 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  40.46 
 
 
477 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  40 
 
 
479 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  40.29 
 
 
476 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  40.25 
 
 
480 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  40.2 
 
 
479 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  39.59 
 
 
479 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  40.34 
 
 
466 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  40.34 
 
 
466 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  39.8 
 
 
481 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  44.14 
 
 
493 aa  364  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1418  amino acid carrier protein  40.09 
 
 
486 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000791908  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1445  amino acid carrier protein  40.09 
 
 
486 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000977985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  40.46 
 
 
477 aa  363  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  40.46 
 
 
477 aa  363  4e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  40.67 
 
 
477 aa  362  9e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  40.46 
 
 
477 aa  361  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  41.31 
 
 
489 aa  361  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  40.46 
 
 
477 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  40.46 
 
 
477 aa  359  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1075  amino acid carrier protein  42.43 
 
 
504 aa  359  5e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124447  hitchhiker  0.00000000000234517 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  40.25 
 
 
477 aa  359  6e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  40.46 
 
 
477 aa  359  7e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  38.87 
 
 
478 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  41.59 
 
 
480 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  39.22 
 
 
480 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  41.09 
 
 
494 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  40.33 
 
 
480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  41.54 
 
 
483 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  42.36 
 
 
503 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  40.45 
 
 
477 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  42.36 
 
 
503 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  42.36 
 
 
503 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>