More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28610 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28610  amino acid carrier protein  100 
 
 		 526 aa  1058    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02700  amino acid carrier protein  68.79 
 
 		 520 aa  672    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.317976  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1843  amino acid carrier protein  59.84 
 
 		 512 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4266  amino acid carrier protein  59.96 
 
 		 517 aa  600  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1862  amino acid carrier protein  59.84 
 
 		 512 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1909  amino acid carrier protein  59.84 
 
 		 512 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2093  amino acid carrier protein  59.08 
 
 		 517 aa  595  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680019  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0706  sodium/alanine symporter family protein  55.78 
 
 		 486 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0549  sodium/alanine symporter family protein  55.58 
 
 		 486 aa  521  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0549  sodium/alanine symporter family protein  55.78 
 
 		 486 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0096  Sodium/alanine symporter  56.8 
 
 		 496 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0673  sodium/alanine symporter family protein  55.33 
 
 		 487 aa  522  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4664  sodium/alanine symporter family protein  55.53 
 
 		 487 aa  525  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.36209e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0767  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  55.53 
 
 		 487 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0617  amino acid carrier protein  53.78 
 
 		 495 aa  518  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0539  amino acid carrier protein  55.53 
 
 		 486 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0377619  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3063  sodium:alanine symporter family protein  53.2 
 
 		 495 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0605  sodium/alanine symporter family protein  55.17 
 
 		 486 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0638  sodium/alanine symporter family protein  55.17 
 
 		 486 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0411  amino acid carrier protein  53.22 
 
 		 493 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1484  amino acid carrier protein  52.44 
 
 		 494 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1431  amino acid carrier protein  53.12 
 
 		 495 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1496  amino acid carrier protein  53.12 
 
 		 495 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3198  amino acid carrier protein  52.64 
 
 		 483 aa  502  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0551  amino acid carrier protein  55.98 
 
 		 486 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1231  amino acid carrier protein  51.21 
 
 		 489 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0597  amino acid carrier protein  52.33 
 
 		 515 aa  488  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0452  amino acid carrier protein  51.79 
 
 		 516 aa  482  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3201  amino acid carrier protein  50.98 
 
 		 505 aa  480  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0770  amino acid carrier protein  53.39 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172723  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004327  sodium/alanine symporter  51.57 
 
 		 515 aa  475  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01084  hypothetical protein  49.63 
 
 		 515 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1030  amino acid carrier protein  48.94 
 
 		 522 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.773393  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1011  amino acid carrier protein  48.94 
 
 		 522 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.56383  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1909  amino acid carrier protein  50.1 
 
 		 507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5793  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2836  sodium/alanine symporter family protein  48.89 
 
 		 496 aa  465  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278121 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2639  sodium/alanine symporter family protein  48.69 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.658687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2590  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  48.89 
 
 		 496 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2555  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  48.89 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2830  sodium/alanine symporter family protein  48.69 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.703902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2633  amino acid carrier protein  48.89 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2881  sodium/alanine symporter family protein  48.4 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202211  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1002  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  49.52 
 
 		 500 aa  455  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2859  sodium/alanine symporter family protein  48.89 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0312  sodium/alanine symporter  49.53 
 
 		 516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2842  sodium/alanine symporter family protein  48.69 
 
 		 496 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.468902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2451  sodium/alanine symporter family protein  48.69 
 
 		 496 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1215  amino acid carrier protein  47.7 
 
 		 482 aa  442  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0620  amino acid carrier protein  48.69 
 
 		 475 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2559  amino acid carrier protein  51.46 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4112  amino acid carrier protein  46.09 
 
 		 481 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0694  sodium/alanine symporter family protein  55.56 
 
 		 385 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  38.71 
 
 		 470 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  38.84 
 
 		 480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  41.39 
 
 		 477 aa  336  7e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  41.51 
 
 		 494 aa  334  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  37.6 
 
 		 480 aa  330  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  37.53 
 
 		 485 aa  330  4e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  39.29 
 
 		 479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  39.29 
 
 		 479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  41.36 
 
 		 471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  39.09 
 
 		 480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  39.09 
 
 		 479 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  39.09 
 
 		 479 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  39.09 
 
 		 479 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  39.09 
 
 		 479 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  38.89 
 
 		 480 aa  326  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  38.69 
 
 		 479 aa  325  9e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  41.36 
 
 		 471 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1075  amino acid carrier protein  39.57 
 
 		 504 aa  325  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124447  hitchhiker  0.00000000000234517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  37.52 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  37.5 
 
 		 476 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  37.1 
 
 		 476 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  37.13 
 
 		 476 aa  323  6e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  37.13 
 
 		 476 aa  323  6e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  37.3 
 
 		 476 aa  323  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  37.13 
 
 		 476 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  37.43 
 
 		 475 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  39.48 
 
 		 466 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  37.65 
 
 		 481 aa  321  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3585  amino acid carrier protein  36.65 
 
 		 509 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  35.97 
 
 		 478 aa  320  5e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  41.31 
 
 		 477 aa  320  6e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  40.61 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  35.84 
 
 		 483 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  39.55 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  35.33 
 
 		 477 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  37.5 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  35.33 
 
 		 477 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21700  amino acid carrier protein  38.39 
 
 		 484 aa  318  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  36.91 
 
 		 483 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  39.48 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  41.6 
 
 		 502 aa  316  8e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  40.29 
 
 		 476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2797  amino acid carrier protein  38.86 
 
 		 543 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566332  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  39.71 
 
 		 498 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5626  Sodium:alanine symporter  37.94 
 
 		 481 aa  312  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28273  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1445  amino acid carrier protein  38.74 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000977985  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1418  amino acid carrier protein  38.74 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000791908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  35.16 
 
 		 477 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>