More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0597 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0597  amino acid carrier protein  100 
 
 
515 aa  1032    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0452  amino acid carrier protein  81.09 
 
 
516 aa  840    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1909  amino acid carrier protein  68.48 
 
 
507 aa  714    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5793  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01084  hypothetical protein  61.71 
 
 
515 aa  632  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004327  sodium/alanine symporter  61.9 
 
 
515 aa  628  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1002  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  61.84 
 
 
500 aa  615  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0312  sodium/alanine symporter  59.61 
 
 
516 aa  600  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2559  amino acid carrier protein  60.27 
 
 
509 aa  588  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1484  amino acid carrier protein  55.86 
 
 
494 aa  548  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1431  amino acid carrier protein  54.55 
 
 
495 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1496  amino acid carrier protein  54.55 
 
 
495 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3063  sodium:alanine symporter family protein  53.24 
 
 
495 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0096  Sodium/alanine symporter  56.01 
 
 
496 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0411  amino acid carrier protein  55.18 
 
 
493 aa  537  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0617  amino acid carrier protein  54.53 
 
 
495 aa  531  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0706  sodium/alanine symporter family protein  54.42 
 
 
486 aa  525  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0549  sodium/alanine symporter family protein  54.22 
 
 
486 aa  524  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0549  sodium/alanine symporter family protein  54.22 
 
 
486 aa  524  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0605  sodium/alanine symporter family protein  53.83 
 
 
486 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4664  sodium/alanine symporter family protein  54.13 
 
 
487 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36209e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0638  sodium/alanine symporter family protein  53.83 
 
 
486 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0673  sodium/alanine symporter family protein  52.95 
 
 
487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0767  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  53.35 
 
 
487 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0539  amino acid carrier protein  52.77 
 
 
486 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0377619  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28610  amino acid carrier protein  52.52 
 
 
526 aa  509  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4266  amino acid carrier protein  48.6 
 
 
517 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176074  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3201  amino acid carrier protein  50.57 
 
 
505 aa  492  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0770  amino acid carrier protein  52.69 
 
 
484 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0551  amino acid carrier protein  53.65 
 
 
486 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1909  amino acid carrier protein  49.25 
 
 
512 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1862  amino acid carrier protein  49.25 
 
 
512 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1843  amino acid carrier protein  49.25 
 
 
512 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3198  amino acid carrier protein  49.51 
 
 
483 aa  481  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2093  amino acid carrier protein  47.77 
 
 
517 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680019  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1231  amino acid carrier protein  48.45 
 
 
489 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02700  amino acid carrier protein  51.76 
 
 
520 aa  476  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.317976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0620  amino acid carrier protein  50.89 
 
 
475 aa  473  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2590  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  47.12 
 
 
496 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2555  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  46.64 
 
 
496 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2836  sodium/alanine symporter family protein  46.92 
 
 
496 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278121 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2639  sodium/alanine symporter family protein  46.45 
 
 
496 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.658687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2830  sodium/alanine symporter family protein  46.45 
 
 
496 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.703902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2633  amino acid carrier protein  45.96 
 
 
496 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2881  sodium/alanine symporter family protein  46.62 
 
 
496 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2859  sodium/alanine symporter family protein  47.02 
 
 
496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1011  amino acid carrier protein  46.84 
 
 
522 aa  442  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.56383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1030  amino acid carrier protein  46.84 
 
 
522 aa  442  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.773393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2451  sodium/alanine symporter family protein  46.24 
 
 
496 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2842  sodium/alanine symporter family protein  46.45 
 
 
496 aa  435  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.468902  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1215  amino acid carrier protein  44.55 
 
 
482 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0694  sodium/alanine symporter family protein  56.68 
 
 
385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  40.65 
 
 
494 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  40.16 
 
 
470 aa  362  8e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  41.02 
 
 
477 aa  351  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  39.62 
 
 
477 aa  352  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4112  amino acid carrier protein  41.56 
 
 
481 aa  350  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  40.31 
 
 
479 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  40.31 
 
 
479 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  40.08 
 
 
479 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  40.31 
 
 
479 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  39.81 
 
 
479 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  39.88 
 
 
479 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  40 
 
 
480 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  39.92 
 
 
479 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  40 
 
 
480 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  40.86 
 
 
466 aa  345  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  38.85 
 
 
480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  40.77 
 
 
493 aa  343  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  41.72 
 
 
458 aa  342  9e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  40.47 
 
 
466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  39.18 
 
 
481 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  41.46 
 
 
502 aa  339  7e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  39.73 
 
 
477 aa  339  9e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  39.73 
 
 
477 aa  339  9e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  39.27 
 
 
480 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  41.98 
 
 
476 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0082  amino acid carrier protein  40.23 
 
 
468 aa  335  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  37.82 
 
 
489 aa  335  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  41.53 
 
 
502 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  40.86 
 
 
457 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1075  amino acid carrier protein  42.18 
 
 
504 aa  331  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124447  hitchhiker  0.00000000000234517 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  39.43 
 
 
498 aa  330  4e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  38.7 
 
 
485 aa  329  7e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  39.8 
 
 
483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  39.88 
 
 
471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  38.19 
 
 
476 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  41.3 
 
 
471 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  37.11 
 
 
478 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  38.19 
 
 
476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  38.39 
 
 
476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  37.84 
 
 
480 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  38.48 
 
 
475 aa  327  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  38.19 
 
 
476 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  39.49 
 
 
477 aa  325  9e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  38.98 
 
 
476 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  39.3 
 
 
477 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  38.98 
 
 
476 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  39.33 
 
 
477 aa  325  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  39.3 
 
 
477 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  39.3 
 
 
477 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>