More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1431 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0539  amino acid carrier protein  64.07 
 
 		 486 aa  653    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0377619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0706  sodium/alanine symporter family protein  65.91 
 
 		 486 aa  669    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0411  amino acid carrier protein  76.53 
 
 		 493 aa  783    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3063  sodium:alanine symporter family protein  93.1 
 
 		 495 aa  940    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0605  sodium/alanine symporter family protein  66.32 
 
 		 486 aa  666    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0549  sodium/alanine symporter family protein  66.12 
 
 		 486 aa  671    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0549  sodium/alanine symporter family protein  65.91 
 
 		 486 aa  670    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0096  Sodium/alanine symporter  67.37 
 
 		 496 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0638  sodium/alanine symporter family protein  66.32 
 
 		 486 aa  666    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0617  amino acid carrier protein  80.81 
 
 		 495 aa  846    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1431  amino acid carrier protein  100 
 
 		 495 aa  1000    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1496  amino acid carrier protein  99.8 
 
 		 495 aa  999    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0770  amino acid carrier protein  66.25 
 
 		 484 aa  642    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4664  sodium/alanine symporter family protein  65.91 
 
 		 487 aa  673    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.36209e-20 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1484  amino acid carrier protein  97.17 
 
 		 494 aa  972    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0551  amino acid carrier protein  67.15 
 
 		 486 aa  653    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0767  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  66.46 
 
 		 487 aa  669    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0673  sodium/alanine symporter family protein  65.71 
 
 		 487 aa  669    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01084  hypothetical protein  59.03 
 
 		 515 aa  590  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004327  sodium/alanine symporter  58.48 
 
 		 515 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0312  sodium/alanine symporter  59.81 
 
 		 516 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1002  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  61.08 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2559  amino acid carrier protein  59.57 
 
 		 509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1231  amino acid carrier protein  56.94 
 
 		 489 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0620  amino acid carrier protein  57.26 
 
 		 475 aa  560  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3198  amino acid carrier protein  56.25 
 
 		 483 aa  556  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1909  amino acid carrier protein  55.69 
 
 		 512 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1862  amino acid carrier protein  55.69 
 
 		 512 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1843  amino acid carrier protein  55.69 
 
 		 512 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2093  amino acid carrier protein  54.6 
 
 		 517 aa  547  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3201  amino acid carrier protein  55.02 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2881  sodium/alanine symporter family protein  53.13 
 
 		 496 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2836  sodium/alanine symporter family protein  52.43 
 
 		 496 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278121 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2590  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  52.35 
 
 		 496 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2555  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  52.56 
 
 		 496 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4266  amino acid carrier protein  53 
 
 		 517 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2633  amino acid carrier protein  52.33 
 
 		 496 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2639  sodium/alanine symporter family protein  52.23 
 
 		 496 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.658687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2830  sodium/alanine symporter family protein  52.23 
 
 		 496 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.703902  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0452  amino acid carrier protein  55.77 
 
 		 516 aa  535  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2859  sodium/alanine symporter family protein  52.97 
 
 		 496 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1909  amino acid carrier protein  51.27 
 
 		 507 aa  529  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5793  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0597  amino acid carrier protein  54.55 
 
 		 515 aa  527  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1215  amino acid carrier protein  50.83 
 
 		 482 aa  520  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2842  sodium/alanine symporter family protein  52.66 
 
 		 496 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.468902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2451  sodium/alanine symporter family protein  52.66 
 
 		 496 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28610  amino acid carrier protein  53.12 
 
 		 526 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02700  amino acid carrier protein  52.27 
 
 		 520 aa  493  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.317976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1011  amino acid carrier protein  52.02 
 
 		 522 aa  491  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.56383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1030  amino acid carrier protein  52.02 
 
 		 522 aa  491  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.773393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0694  sodium/alanine symporter family protein  68.68 
 
 		 385 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4112  amino acid carrier protein  48.84 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  41.56 
 
 		 470 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  41.63 
 
 		 476 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  40.41 
 
 		 480 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  41.43 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  41.63 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  41.63 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  41.63 
 
 		 476 aa  398  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  40.08 
 
 		 479 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  40.53 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  41.43 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  41.07 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  41.43 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  40.33 
 
 		 479 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  40.28 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  39.88 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  40.33 
 
 		 479 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  40.45 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  39.88 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  43.43 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  43.44 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  39.68 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  43.95 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  39.88 
 
 		 481 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  39.87 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3585  amino acid carrier protein  39.67 
 
 		 509 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  43.58 
 
 		 477 aa  375  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  40.59 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  39.71 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  40.17 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  38.88 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  38.88 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1418  amino acid carrier protein  43.43 
 
 		 486 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000791908  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1445  amino acid carrier protein  43.43 
 
 		 486 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000977985  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  41.21 
 
 		 477 aa  369  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  38.57 
 
 		 477 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  43.59 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  38.46 
 
 		 489 aa  365  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  38.6 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  38.57 
 
 		 477 aa  362  8e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  38.57 
 
 		 477 aa  362  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  41.41 
 
 		 504 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  38.68 
 
 		 477 aa  362  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  38.68 
 
 		 477 aa  362  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  38.68 
 
 		 477 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  41.2 
 
 		 504 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  38.68 
 
 		 477 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  41.15 
 
 		 495 aa  360  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  43.01 
 
 		 474 aa  359  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>