More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0312 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1909  amino acid carrier protein  65.73 
 
 		 507 aa  682    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5793  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2559  amino acid carrier protein  71.6 
 
 		 509 aa  697    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0312  sodium/alanine symporter  100 
 
 		 516 aa  1036    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004327  sodium/alanine symporter  86.41 
 
 		 515 aa  922    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1002  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  83.53 
 
 		 500 aa  838    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01084  hypothetical protein  87.38 
 
 		 515 aa  928    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0452  amino acid carrier protein  60.23 
 
 		 516 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1431  amino acid carrier protein  59.81 
 
 		 495 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1496  amino acid carrier protein  60 
 
 		 495 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1484  amino acid carrier protein  59.77 
 
 		 494 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3063  sodium:alanine symporter family protein  59.03 
 
 		 495 aa  594  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0597  amino acid carrier protein  59.61 
 
 		 515 aa  591  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0617  amino acid carrier protein  58.59 
 
 		 495 aa  588  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0411  amino acid carrier protein  58.09 
 
 		 493 aa  589  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0549  sodium/alanine symporter family protein  58.27 
 
 		 486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0096  Sodium/alanine symporter  61.87 
 
 		 496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0706  sodium/alanine symporter family protein  58.27 
 
 		 486 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0549  sodium/alanine symporter family protein  58.07 
 
 		 486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0605  sodium/alanine symporter family protein  57.87 
 
 		 486 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4664  sodium/alanine symporter family protein  57.68 
 
 		 487 aa  569  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.36209e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0638  sodium/alanine symporter family protein  57.87 
 
 		 486 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0767  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  57.28 
 
 		 487 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0673  sodium/alanine symporter family protein  57.28 
 
 		 487 aa  568  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0770  amino acid carrier protein  61.38 
 
 		 484 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0539  amino acid carrier protein  56.3 
 
 		 486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0377619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0551  amino acid carrier protein  57.87 
 
 		 486 aa  537  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1231  amino acid carrier protein  53.16 
 
 		 489 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0620  amino acid carrier protein  54.36 
 
 		 475 aa  516  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1843  amino acid carrier protein  53.86 
 
 		 512 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1862  amino acid carrier protein  53.86 
 
 		 512 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1909  amino acid carrier protein  53.86 
 
 		 512 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3198  amino acid carrier protein  51.7 
 
 		 483 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4266  amino acid carrier protein  51.04 
 
 		 517 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3201  amino acid carrier protein  53.95 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2093  amino acid carrier protein  51.52 
 
 		 517 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680019  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2590  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  47.5 
 
 		 496 aa  472  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2836  sodium/alanine symporter family protein  47.31 
 
 		 496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278121 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2881  sodium/alanine symporter family protein  47.69 
 
 		 496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2633  amino acid carrier protein  47.3 
 
 		 496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2639  sodium/alanine symporter family protein  47.12 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.658687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2555  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  48.51 
 
 		 496 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2830  sodium/alanine symporter family protein  47.12 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.703902  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28610  amino acid carrier protein  49.53 
 
 		 526 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2859  sodium/alanine symporter family protein  47.12 
 
 		 496 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2842  sodium/alanine symporter family protein  48.23 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.468902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2451  sodium/alanine symporter family protein  48.53 
 
 		 496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1011  amino acid carrier protein  47.65 
 
 		 522 aa  438  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.56383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1030  amino acid carrier protein  47.65 
 
 		 522 aa  438  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.773393  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1215  amino acid carrier protein  46.34 
 
 		 482 aa  429  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02700  amino acid carrier protein  48.95 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.317976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0694  sodium/alanine symporter family protein  59.3 
 
 		 385 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4112  amino acid carrier protein  48.06 
 
 		 481 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  40.8 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  39.67 
 
 		 494 aa  356  5.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  41.65 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  40.33 
 
 		 477 aa  353  5e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  39.92 
 
 		 479 aa  349  7e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  40.85 
 
 		 466 aa  349  7e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  40.12 
 
 		 479 aa  349  8e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  40.12 
 
 		 479 aa  349  8e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  40.12 
 
 		 479 aa  349  8e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  40.12 
 
 		 479 aa  349  8e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  39.92 
 
 		 479 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  40 
 
 		 480 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1075  amino acid carrier protein  40.91 
 
 		 504 aa  346  5e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124447  hitchhiker  0.00000000000234517 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  38.6 
 
 		 480 aa  346  5e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  40 
 
 		 480 aa  346  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  39.18 
 
 		 489 aa  346  6e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  42.02 
 
 		 493 aa  346  6e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  39.72 
 
 		 479 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  39.45 
 
 		 481 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  40.24 
 
 		 466 aa  345  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  39.57 
 
 		 485 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  41.46 
 
 		 498 aa  343  5e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  39.71 
 
 		 477 aa  341  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  37.9 
 
 		 477 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  37.9 
 
 		 477 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  42.2 
 
 		 471 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  40.73 
 
 		 471 aa  339  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  39.54 
 
 		 480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  40.96 
 
 		 476 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  40.33 
 
 		 502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  38.88 
 
 		 475 aa  335  7.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  38.57 
 
 		 476 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  37.4 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  38.57 
 
 		 483 aa  334  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  38.78 
 
 		 476 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  38.78 
 
 		 476 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  38.78 
 
 		 476 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  38.22 
 
 		 477 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  39.96 
 
 		 457 aa  333  5e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  38.78 
 
 		 476 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  38.78 
 
 		 476 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  37.28 
 
 		 476 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  39.56 
 
 		 502 aa  331  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  37.17 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  41.16 
 
 		 470 aa  331  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  38.46 
 
 		 480 aa  331  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3585  amino acid carrier protein  38.4 
 
 		 509 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  37.28 
 
 		 477 aa  330  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>