More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A3218 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  86.49 
 
 
497 aa  841    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  87.63 
 
 
504 aa  830    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  89.33 
 
 
495 aa  850    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  100 
 
 
503 aa  988    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  99.8 
 
 
503 aa  984    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  100 
 
 
503 aa  988    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  84.83 
 
 
496 aa  836    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  100 
 
 
503 aa  988    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  97.61 
 
 
503 aa  969    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  100 
 
 
503 aa  988    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  87.02 
 
 
497 aa  845    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  99.8 
 
 
503 aa  985    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  85.08 
 
 
504 aa  828    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  99.8 
 
 
503 aa  984    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  87.02 
 
 
497 aa  845    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  55.51 
 
 
494 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  55.86 
 
 
477 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  56.05 
 
 
476 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  52.54 
 
 
477 aa  488  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  51.83 
 
 
458 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  52.63 
 
 
489 aa  476  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  50.75 
 
 
466 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  52.61 
 
 
470 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  52.79 
 
 
498 aa  474  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  50.75 
 
 
466 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  49.9 
 
 
479 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  50.31 
 
 
481 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  49.48 
 
 
479 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  49.69 
 
 
479 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  49.48 
 
 
479 aa  462  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  50.1 
 
 
480 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  49.69 
 
 
479 aa  465  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  49.48 
 
 
479 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  49.69 
 
 
479 aa  465  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  50.1 
 
 
480 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  47.99 
 
 
476 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  51.42 
 
 
457 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  47.78 
 
 
476 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  47.99 
 
 
476 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  47.78 
 
 
476 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  47.78 
 
 
476 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  55.51 
 
 
474 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  47.15 
 
 
476 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  48.45 
 
 
480 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  47.57 
 
 
476 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  47.78 
 
 
476 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  51.42 
 
 
502 aa  448  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  51.68 
 
 
493 aa  451  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  48.5 
 
 
478 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2897  amino acid carrier protein  50.32 
 
 
480 aa  445  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  48.31 
 
 
480 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  48.46 
 
 
477 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  48.46 
 
 
477 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  51.26 
 
 
471 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  49.68 
 
 
483 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  48.67 
 
 
488 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  51.05 
 
 
471 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4714  amino acid carrier protein  53.59 
 
 
484 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  46.25 
 
 
480 aa  433  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  50.66 
 
 
479 aa  432  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  48.94 
 
 
485 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  48.46 
 
 
477 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  47.72 
 
 
477 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1200  amino acid carrier protein  50.73 
 
 
484 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.294812  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  47.52 
 
 
477 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  47.57 
 
 
485 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3242  amino acid carrier protein  49.79 
 
 
480 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  48.03 
 
 
477 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  50 
 
 
492 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1148  amino acid carrier protein  49.79 
 
 
480 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209129  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  47.72 
 
 
477 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  47.51 
 
 
477 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1052  amino acid carrier protein  50.11 
 
 
481 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  47.7 
 
 
477 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1114  amino acid carrier protein  49.79 
 
 
480 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000596574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  47.51 
 
 
477 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  47.88 
 
 
493 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  51.26 
 
 
502 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3165  sodium/alanine symporter family protein  47.06 
 
 
474 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3541  sodium:alanine symporter family protein  50.42 
 
 
488 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2908  amino acid carrier protein (sodium/alanine symporter)  47.06 
 
 
474 aa  425  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.975197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3172  sodium/alanine symporter family protein  46.95 
 
 
474 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1241  amino acid carrier protein  53.26 
 
 
471 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.912525  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2964  amino acid carrier protein  49.27 
 
 
488 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.302472  normal  0.844283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3144  amino acid carrier protein  49.48 
 
 
488 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0262714  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1047  amino acid carrier protein  49.79 
 
 
480 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2858  sodium/alanine symporter family protein  46.64 
 
 
474 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.430762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3144  sodium/alanine symporter family protein  46.64 
 
 
474 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2096  sodium/alanine symporter family protein  46.64 
 
 
474 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  48.73 
 
 
470 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6060  amino acid carrier protein  50.85 
 
 
472 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186071  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5996  amino acid carrier protein  50.85 
 
 
472 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.188928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10930  amino acid carrier protein  51.02 
 
 
490 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2730  amino acid carrier protein  48.82 
 
 
504 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000165436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0082  amino acid carrier protein  48.52 
 
 
468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  46.35 
 
 
485 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5626  Sodium:alanine symporter  44.79 
 
 
481 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28273  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0006  amino-acid carrier protein AlsT  46.35 
 
 
485 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0332289  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  46.35 
 
 
476 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.557087  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0422  amino acid carrier family protein  49.05 
 
 
477 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.797168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>