21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000963 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000963  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  592  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00889033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07003  hypothetical protein  93.48 
 
 		 276 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0190  hypothetical protein  66.32 
 
 		 307 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0041  hypothetical protein  42.38 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686765  hitchhiker  0.000596496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2367  hypothetical protein  40.48 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0451  hypothetical protein  37.62 
 
 		 237 aa  159  7e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  32.5 
 
 		 914 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4234  hypothetical protein  42.42 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  43.94 
 
 		 1004 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  43.94 
 
 		 996 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  27.52 
 
 		 995 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  42.42 
 
 		 996 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  42.42 
 
 		 996 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000139  hypothetical protein  35.82 
 
 		 234 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.388836  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  29.08 
 
 		 957 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05763  hypothetical protein  34.85 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  38.1 
 
 		 1010 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  35.94 
 
 		 971 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  30.17 
 
 		 1020 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  25.44 
 
 		 1042 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  27.78 
 
 		 917 aa  42.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>