20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0451 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0451  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  476  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0190  hypothetical protein  41.43 
 
 
307 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2367  hypothetical protein  38.71 
 
 
279 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000963  hypothetical protein  37.62 
 
 
288 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00889033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07003  hypothetical protein  37.14 
 
 
276 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0041  hypothetical protein  41.05 
 
 
306 aa  155  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686765  hitchhiker  0.000596496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  27.59 
 
 
996 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  27.59 
 
 
996 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  27.59 
 
 
996 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 
1004 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  24.27 
 
 
914 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  29.17 
 
 
995 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 
1020 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  31.31 
 
 
957 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  30.21 
 
 
917 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  30.08 
 
 
978 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  26.12 
 
 
916 aa  46.2  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  26.27 
 
 
1010 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  24.81 
 
 
996 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  30.23 
 
 
972 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>