19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2367 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2367  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  584  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0041  hypothetical protein  43.21 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686765  hitchhiker  0.000596496 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000963  hypothetical protein  40.48 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00889033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07003  hypothetical protein  41.9 
 
 		 276 aa  185  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0451  hypothetical protein  38.71 
 
 		 237 aa  168  9e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0190  hypothetical protein  36.67 
 
 		 307 aa  165  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  35.09 
 
 		 996 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  28.23 
 
 		 914 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  34.21 
 
 		 996 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  29.75 
 
 		 995 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  34.21 
 
 		 996 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 1004 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  32.03 
 
 		 1010 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  34.29 
 
 		 1042 aa  49.3  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  30.09 
 
 		 971 aa  46.6  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  28.03 
 
 		 978 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  30.69 
 
 		 957 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4970  hypothetical protein  25 
 
 		 822 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3707  ATPase  33.33 
 
 		 1277 aa  42.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.405586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>