18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0041 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0041  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686765  hitchhiker  0.000596496 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0190  hypothetical protein  40 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000963  hypothetical protein  42.38 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00889033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07003  hypothetical protein  41.87 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2367  hypothetical protein  44.59 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0451  hypothetical protein  41.05 
 
 		 237 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4970  hypothetical protein  33.08 
 
 		 822 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3707  ATPase  35.23 
 
 		 1277 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.405586  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  28.04 
 
 		 914 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5144  hypothetical protein  28.79 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261429 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0695  hypothetical protein  35.38 
 
 		 248 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  31.06 
 
 		 957 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  31.5 
 
 		 996 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  28.35 
 
 		 1004 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  30.71 
 
 		 996 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1196  hypothetical protein  30.16 
 
 		 231 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.620919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  30.71 
 
 		 996 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0666  hypothetical protein  30.77 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000210215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>