23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0190 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0190  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  637    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000963  hypothetical protein  66.32 
 
 		 288 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00889033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07003  hypothetical protein  67.27 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0041  hypothetical protein  40 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686765  hitchhiker  0.000596496 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0451  hypothetical protein  41.43 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2367  hypothetical protein  36.67 
 
 		 279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  39.6 
 
 		 996 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  38.61 
 
 		 996 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2255  UvrD/REP helicase  30.51 
 
 		 1020 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  37.62 
 
 		 996 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  35.64 
 
 		 1004 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  31.54 
 
 		 914 aa  53.1  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  25.89 
 
 		 995 aa  52.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  30.08 
 
 		 957 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  31.43 
 
 		 1010 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05763  hypothetical protein  35.94 
 
 		 236 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  36.62 
 
 		 971 aa  49.7  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4234  hypothetical protein  37.5 
 
 		 233 aa  46.6  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0695  hypothetical protein  36.36 
 
 		 248 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  27.69 
 
 		 1042 aa  46.6  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5144  hypothetical protein  32.81 
 
 		 239 aa  46.2  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261429 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000139  hypothetical protein  31.34 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.388836  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0666  hypothetical protein  34.85 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000210215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>