20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_07003 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07003  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000963  hypothetical protein  93.48 
 
 		 288 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00889033  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0190  hypothetical protein  67.27 
 
 		 307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0041  hypothetical protein  41.87 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686765  hitchhiker  0.000596496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2367  hypothetical protein  41.9 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0451  hypothetical protein  37.14 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.000000000345856  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  30.83 
 
 		 914 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4082  UvrD/REP helicase  35.64 
 
 		 996 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.482506  decreased coverage  0.00177204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  35.64 
 
 		 1004 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3966  UvrD/REP helicase  34.65 
 
 		 996 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000647136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  42.42 
 
 		 996 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0452  UvrD/REP helicase  27.52 
 
 		 995 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.155491  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  33.33 
 
 		 1010 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2269  UvrD/REP helicase  28.77 
 
 		 957 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975184  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4234  hypothetical protein  42.86 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2104  UvrD/REP helicase  35.94 
 
 		 971 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  25.44 
 
 		 1042 aa  42.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000139  hypothetical protein  42.86 
 
 		 234 aa  42.7  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.388836  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  28.09 
 
 		 917 aa  42.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05763  hypothetical protein  41.46 
 
 		 236 aa  42  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>