30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0839 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0839  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  640    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.276132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2389  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.69 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0736941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0900  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.77 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2270  xylose isomerase-like TIM barrel  34.93 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.387608  hitchhiker  0.00112275 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.13 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0870  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.37 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.505971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1924  Hydroxypyruvate isomerase  33.08 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334865  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  26.11 
 
 		 250 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2228  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.28 
 
 		 287 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498591  normal  0.437814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0423  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.53 
 
 		 287 aa  53.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  27.43 
 
 		 272 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3371  Hydroxypyruvate isomerase  24.02 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55933  normal  0.171039 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1112  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.95 
 
 		 259 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3575  xylose isomerase domain-containing protein  25.32 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4865  hydroxypyruvate isomerase Gcxl  22.65 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.798851  normal  0.469511 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.71 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.787534  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3269  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.09 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2364  xylose isomerase domain-containing protein  22.08 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.807591  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3461  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.73 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.32 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2206  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.07 
 
 		 260 aa  46.6  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313924  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0015  hydroxypyruvate isomerase  28.66 
 
 		 258 aa  46.2  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3292  hydroxypyruvate isomerase  26.7 
 
 		 260 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.202186  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.67 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1041  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.85 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3407  hydroxypyruvate isomerase  26.64 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  decreased coverage  0.0000181243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5064  hydroxypyruvate isomerase, putative  22.89 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.78 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3152  hydroxypyruvate isomerase  26.37 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5018  hydroxypyruvate isomerase  23 
 
 		 258 aa  42.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>