193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1667 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0267  transposase IS3/IS911 family protein  99.08 
 
 
387 aa  217  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118178  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1667  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
109 aa  217  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.135875  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0273  transposase IS3/IS911 family protein  99.08 
 
 
109 aa  214  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.732327  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2607  transposase IS3/IS911 family protein  99.08 
 
 
109 aa  214  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3219  transposase IS3/IS911 family protein  99.08 
 
 
109 aa  214  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2472  transposase IS3/IS911 family protein  99.08 
 
 
109 aa  214  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0303  transposase IS3/IS911 family protein  99.08 
 
 
109 aa  214  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.809623  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0278  transposase IS3/IS911 family protein  99.08 
 
 
109 aa  214  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1647  transposase IS3/IS911 family protein  99.08 
 
 
109 aa  214  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2153  transposase IS3/IS911 family protein  52.03 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3286  transposase IS3/IS911 family protein  49.54 
 
 
109 aa  96.7  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0803  transposase IS3/IS911 family protein  48.62 
 
 
109 aa  94.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0576  transposase IS3/IS911 family protein  47.27 
 
 
110 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3742  transposase IS3/IS911 family protein  47.27 
 
 
110 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1627  transposase IS3/IS911  47.79 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.683262  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3190  transposase IS3/IS911  47.79 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39399  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1653  transposase IS3/IS911 family protein  47.79 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3252  transposase IS3/IS911 family protein  47.79 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0478749  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1669  transposase IS3/IS911 family protein  47.79 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0827907  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2247  transposase IS3/IS911 family protein  47.79 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249628  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2584  transposase IS3/IS911 family protein  47.79 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2854  transposase IS3/IS911 family protein  47.79 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0560  transposase IS3/IS911 family protein  47.79 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504625  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0577  transposase IS3/IS911 family protein  47.79 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0609  transposase IS3/IS911 family protein  47.79 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1999  transposase IS3/IS911 family protein  47.79 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2229  transposase IS3/IS911 family protein  47.79 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505397  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0582  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.312881  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5605  putative transposase  46.34 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583232  normal  0.702403 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5825  putative transposase  46.34 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280519 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  37.74 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  35.19 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  33.64 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  30.56 
 
 
93 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  30.56 
 
 
93 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  30.56 
 
 
93 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  30.56 
 
 
93 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0282  ISMca2, transposase, OrfA  38.68 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0906  ISMca2, transposase, OrfA  38.68 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.252803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  37.14 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  37.14 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3370  transposase IS3/IS911 family protein  36.19 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  32.38 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  32.38 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0627  transposase IS3/IS911 family protein  35.24 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5328  transposase IS3/IS911 family protein  35.24 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  35.85 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  35.85 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6988  hypothetical protein  38.14 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.828918  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  35.85 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5188  transposase IS3/IS911 family protein  35.24 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0746115  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  38.46 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  38.46 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  31.78 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  31.78 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  32.71 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  36.19 
 
 
98 aa  47.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  36.19 
 
 
98 aa  47.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  33.64 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  34.62 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
101 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  32.11 
 
 
92 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  32.11 
 
 
92 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  32.11 
 
 
92 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  36.79 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  32.71 
 
 
100 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  31.73 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  31.73 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  31.73 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  31.73 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  31.73 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  31.73 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  36.54 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  32.41 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  32.41 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  32.41 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  32.41 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  32.71 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  34.62 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  34.62 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  29.91 
 
 
383 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0760  transposase IS3/IS911 family protein  24.69 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  34.91 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  34.91 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3957  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  34.31 
 
 
106 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>