71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5825 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008704  Mkms_5825  putative transposase  100 
 
 
83 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280519 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5605  putative transposase  100 
 
 
83 aa  167  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583232  normal  0.702403 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1627  transposase IS3/IS911  80.49 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.683262  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3252  transposase IS3/IS911 family protein  80.49 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0478749  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1653  transposase IS3/IS911 family protein  80.49 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1669  transposase IS3/IS911 family protein  80.49 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0827907  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3190  transposase IS3/IS911  80.49 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39399  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0577  transposase IS3/IS911 family protein  80.49 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2247  transposase IS3/IS911 family protein  80.49 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249628  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2854  transposase IS3/IS911 family protein  80.49 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2584  transposase IS3/IS911 family protein  80.49 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1999  transposase IS3/IS911 family protein  80.49 
 
 
110 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2229  transposase IS3/IS911 family protein  80.49 
 
 
110 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505397  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0609  transposase IS3/IS911 family protein  79.27 
 
 
110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0560  transposase IS3/IS911 family protein  79.27 
 
 
110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0582  transposase IS3/IS911 family protein  74.39 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.312881  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3742  transposase IS3/IS911 family protein  74.39 
 
 
110 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0576  transposase IS3/IS911 family protein  74.39 
 
 
110 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3286  transposase IS3/IS911 family protein  63.86 
 
 
109 aa  97.1  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0803  transposase IS3/IS911 family protein  62.65 
 
 
109 aa  94.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0273  transposase IS3/IS911 family protein  47.56 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.732327  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0278  transposase IS3/IS911 family protein  47.56 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0303  transposase IS3/IS911 family protein  47.56 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.809623  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1647  transposase IS3/IS911 family protein  47.56 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2472  transposase IS3/IS911 family protein  47.56 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2607  transposase IS3/IS911 family protein  47.56 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3219  transposase IS3/IS911 family protein  47.56 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0267  transposase IS3/IS911 family protein  47.56 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118178  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2153  transposase IS3/IS911 family protein  41.05 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1667  transposase IS3/IS911 family protein  46.34 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.135875  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  43.9 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  43.9 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  43.9 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  43.9 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  43.9 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  43.9 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  43.9 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  43.9 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  43.9 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  43.9 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  43.9 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  43.9 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  43.9 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  45.68 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  45.68 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  36.25 
 
 
93 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  36.25 
 
 
93 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  36.25 
 
 
93 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  36.25 
 
 
93 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
92 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  40 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  42.86 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  40.26 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  39.02 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  41.56 
 
 
99 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0731  transposase IS3/IS911 family protein  36.49 
 
 
102 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0479858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  41.56 
 
 
99 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  32.1 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  32.1 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  32.1 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  36.99 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  35.06 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  35.06 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  35.06 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  35.06 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  35.06 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  35.06 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20920  Transposase  36.14 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1916  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407411  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  35.06 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>