116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2153 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2153  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0267  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118178  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2607  transposase IS3/IS911 family protein  52.03 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2472  transposase IS3/IS911 family protein  52.03 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0273  transposase IS3/IS911 family protein  52.03 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.732327  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1647  transposase IS3/IS911 family protein  52.03 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0278  transposase IS3/IS911 family protein  52.03 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0303  transposase IS3/IS911 family protein  52.03 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.809623  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3219  transposase IS3/IS911 family protein  52.03 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1667  transposase IS3/IS911 family protein  52.03 
 
 
109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.135875  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3286  transposase IS3/IS911 family protein  51.61 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0803  transposase IS3/IS911 family protein  50.81 
 
 
109 aa  110  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0576  transposase IS3/IS911 family protein  48.78 
 
 
110 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3742  transposase IS3/IS911 family protein  48.78 
 
 
110 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1627  transposase IS3/IS911  47.15 
 
 
110 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.683262  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3190  transposase IS3/IS911  47.15 
 
 
110 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39399  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1653  transposase IS3/IS911 family protein  47.15 
 
 
110 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3252  transposase IS3/IS911 family protein  47.15 
 
 
110 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0478749  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1669  transposase IS3/IS911 family protein  47.15 
 
 
110 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0827907  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2247  transposase IS3/IS911 family protein  47.15 
 
 
110 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249628  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2584  transposase IS3/IS911 family protein  47.15 
 
 
110 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2854  transposase IS3/IS911 family protein  47.15 
 
 
110 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0560  transposase IS3/IS911 family protein  47.15 
 
 
110 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504625  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0577  transposase IS3/IS911 family protein  47.15 
 
 
110 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0609  transposase IS3/IS911 family protein  47.15 
 
 
110 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1999  transposase IS3/IS911 family protein  46.34 
 
 
110 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2229  transposase IS3/IS911 family protein  46.34 
 
 
110 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505397  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0582  transposase IS3/IS911 family protein  44.34 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.312881  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5605  putative transposase  41.05 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583232  normal  0.702403 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5825  putative transposase  41.05 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0616  hypothetical protein  84.62 
 
 
89 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  31.97 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  31.97 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  31.97 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  31.4 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  31.97 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1507  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
88 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000019748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1944  transposase IS3/IS911 family protein  29.03 
 
 
104 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2003  transposase IS3/IS911 family protein  29.03 
 
 
104 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523186  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0339  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0453  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0841  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1031  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1104  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.339333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3275  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3600  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3731  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4160  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4228  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4249  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4971  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184087  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0714  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0758  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0453356  hitchhiker  0.00246482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0762  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0302585  hitchhiker  0.00264587 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0764  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.416197  hitchhiker  0.0022946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0799  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0297207  hitchhiker  0.00184796 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1528  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000359227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1530  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000372695 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1592  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000200325  unclonable  8.37308e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1978  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1985  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.982856  normal  0.0748906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2131  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2525  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2554  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2828  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  26.96 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  26.96 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  26.96 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  26.96 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  26.96 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  26.96 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0256  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.103856 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  27.27 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  27.27 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  27.27 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  27.27 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  32.5 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  32.5 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  32.5 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  32.5 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  32.5 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  32.5 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  32.5 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  32.5 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  32.5 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  32.5 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  32.5 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  26.05 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  26.05 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  30.65 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  30.65 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  32.5 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  32.5 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  32.23 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1945  transposase IS3/IS911 family protein  25.42 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2164  transposase IS3/IS911 family protein  25.42 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0780617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2284  transposase IS3/IS911 family protein  25.42 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  28.1 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  29.75 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  31.62 
 
 
101 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>