62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1211 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1211  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1777  type IV pilus assembly protein PilZ  29.6 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0920  hypothetical protein  25.89 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2856  type IV pilus assembly PilZ  27.11 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535348  normal  0.192411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20700  putative glycosyltransferase  30.04 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4397  type IV pilus assembly PilZ  27.69 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3490  hypothetical protein  27.09 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1457  type IV pilus assembly PilZ  27.31 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4257  hypothetical protein  27.53 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1923  hypothetical protein  26.96 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.442768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3738  type IV pilus assembly PilZ  28.79 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146635  normal  0.808645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3958  type IV pilus assembly PilZ  28.24 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2358  YcgR family protein  25.78 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4582  YcgR family protein  26.7 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2895  type IV pilus assembly PilZ  25.81 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.483653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1850  YcgR family protein  25.14 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184522 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1520  YcgR family protein  25.75 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1936  YcgR family protein  25.32 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.447296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1940  YcgR family protein  25.32 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.426731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1954  putative type IV pilus assembly protein PilZ  26.72 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.165667  normal  0.123156 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2431  YcgR family protein  26.79 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517403  normal  0.384993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1335  YcgR family protein  25.32 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0341188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01179  hypothetical protein  26.79 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.507814  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2454  YcgR family protein  26.79 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00258374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01169  YcgR  26.79 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2316  YcgR family protein  23.08 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1297  putative type IV pilus assembly protein PilZ  26.34 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1339  putative type IV pilus assembly protein PilZ  26.34 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.905836  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1996  hypothetical protein  24.89 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0896  putative YcgR-like protein  25.65 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.74738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1352  putative type IV pilus assembly protein PilZ  25.89 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2031  YcgR family protein  25 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1758  YcgR family protein  21.54 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2214  YcgR family protein  22.01 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2541  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 		 588 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27860  Metal-dependent phosphohydrolase, HD domain protein  30.53 
 
 		 563 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0249  YcgR protein superfamily protein  24.04 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5312  YcgR  21.38 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3345  hypothetical protein  24.04 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0472  YcgR protein superfamily protein  24.04 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3334  hypothetical protein  24.04 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0287  hypothetical protein  24.04 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3061  YcgR family protein  25 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2957  YcgR family protein  24.38 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2926  YcgR family protein  25 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3003  hypothetical protein  24.04 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551391  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2090  hypothetical protein  24.04 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0275  hypothetical protein  24.04 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3338  YcgR  25.38 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035221 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3286  YcgR family protein  21.63 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6362  YcgR family protein  24.49 
 
 		 251 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2894  type IV pilus assembly PilZ  24 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.893186  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3148  pilZ family protein  21.46 
 
 		 249 aa  45.4  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.337895  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1597  hypothetical protein  21.08 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.916917 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3299  hypothetical protein  22.45 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0132332  normal  0.0732799 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5917  putative YcgR-like protein; putative protein involved in flagellar function  25 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.73115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00049  type IV pilus assembly protein PilZ  21.63 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3016  YcgR family protein  28.47 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0561484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3035  YcgR family protein  28.47 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2402  YcgR  28.47 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0872  glycosyltransferase-like protein  32.52 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3785  YcgR family protein  25.48 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>