24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4397 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4397  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 247 aa  513  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1457  type IV pilus assembly PilZ  98.79 
 
 		 247 aa  507  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3958  type IV pilus assembly PilZ  97.57 
 
 		 247 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3738  type IV pilus assembly PilZ  91.09 
 
 		 247 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146635  normal  0.808645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3490  hypothetical protein  73.44 
 
 		 248 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1923  hypothetical protein  72.2 
 
 		 248 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.442768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4257  hypothetical protein  69.39 
 
 		 244 aa  355  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2856  type IV pilus assembly PilZ  56.56 
 
 		 249 aa  293  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535348  normal  0.192411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20700  putative glycosyltransferase  56.33 
 
 		 263 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1777  type IV pilus assembly protein PilZ  56.15 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1211  glycosyltransferase-like protein  27.69 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27860  Metal-dependent phosphohydrolase, HD domain protein  30.34 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4582  YcgR family protein  24.89 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0920  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0896  putative YcgR-like protein  24.45 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.74738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1520  YcgR family protein  24.05 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2957  YcgR family protein  23.25 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1936  YcgR family protein  23.63 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.447296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1940  YcgR family protein  23.63 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.426731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2895  type IV pilus assembly PilZ  22.07 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.483653  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1996  hypothetical protein  23.63 
 
 		 244 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1335  YcgR family protein  23.63 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0341188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2567  YcgR family protein  26.52 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2358  YcgR family protein  24.18 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>