42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0920 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0920  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1211  glycosyltransferase-like protein  25.89 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1850  YcgR family protein  27.22 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2856  type IV pilus assembly PilZ  27.03 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535348  normal  0.192411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2926  YcgR family protein  28.93 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3061  YcgR family protein  28.93 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3035  YcgR family protein  29.92 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3016  YcgR family protein  29.92 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0561484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2402  YcgR  29.92 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1923  hypothetical protein  24.45 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.442768  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6362  YcgR family protein  29.51 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5917  putative YcgR-like protein; putative protein involved in flagellar function  25.88 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.73115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3490  hypothetical protein  25.89 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1777  type IV pilus assembly protein PilZ  28.28 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4397  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0777  YcgR  22.63 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20700  putative glycosyltransferase  25.65 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1457  type IV pilus assembly PilZ  24.58 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1597  hypothetical protein  30.26 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.916917 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3011  YcgR family protein  27.87 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3785  YcgR family protein  28.35 
 
 		 257 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3958  type IV pilus assembly PilZ  23.83 
 
 		 247 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1606  YcgR  25.41 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017859  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3334  hypothetical protein  28 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0287  hypothetical protein  28 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0275  hypothetical protein  28 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2090  hypothetical protein  28 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3003  hypothetical protein  28 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551391  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3345  hypothetical protein  28 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0472  YcgR protein superfamily protein  28 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3738  type IV pilus assembly PilZ  23.38 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146635  normal  0.808645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5312  YcgR  25.9 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2895  type IV pilus assembly PilZ  26.6 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.483653  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1857  type IV pilus assembly PilZ  28.46 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0249  YcgR protein superfamily protein  27 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2894  type IV pilus assembly PilZ  29.17 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.893186  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0149  hypothetical protein  26.69 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.554596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4257  hypothetical protein  22.84 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27860  Metal-dependent phosphohydrolase, HD domain protein  29.55 
 
 		 563 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0896  putative YcgR-like protein  27.59 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.74738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4582  YcgR family protein  26.98 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2957  YcgR family protein  25.98 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>