58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1606 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1606  YcgR  100 
 
 		 258 aa  535  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017859  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2895  type IV pilus assembly PilZ  28.51 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.483653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0777  YcgR  25.79 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101382 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1597  hypothetical protein  26.38 
 
 		 255 aa  92.4  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.916917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3338  YcgR  25.41 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035221 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2894  type IV pilus assembly PilZ  26.56 
 
 		 259 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.893186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1850  YcgR family protein  26.69 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184522 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00049  type IV pilus assembly protein PilZ  25.63 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0149  hypothetical protein  27.8 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.554596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2957  YcgR family protein  30.39 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3785  YcgR family protein  28.02 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0896  putative YcgR-like protein  26.13 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.74738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3299  hypothetical protein  25.93 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0132332  normal  0.0732799 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3286  YcgR family protein  25.93 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1335  YcgR family protein  26.36 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0341188  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1996  hypothetical protein  26.36 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1520  YcgR family protein  26.36 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3148  pilZ family protein  25.93 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.337895  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4582  YcgR family protein  26.58 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2316  YcgR family protein  29.2 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1936  YcgR family protein  26.38 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.447296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1940  YcgR family protein  26.38 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.426731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5917  putative YcgR-like protein; putative protein involved in flagellar function  24.81 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.73115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1954  putative type IV pilus assembly protein PilZ  25.39 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.165667  normal  0.123156 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1352  putative type IV pilus assembly protein PilZ  25.39 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2926  YcgR family protein  28.14 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2431  YcgR family protein  25.79 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517403  normal  0.384993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01179  hypothetical protein  25.79 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.507814  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2454  YcgR family protein  25.79 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00258374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1339  putative type IV pilus assembly protein PilZ  25.79 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.905836  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1297  putative type IV pilus assembly protein PilZ  25.79 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396022  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3061  YcgR family protein  28.14 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01169  YcgR  25.79 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0249  YcgR protein superfamily protein  26.73 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1014  type IV pilus assembly PilZ  25.51 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2214  YcgR family protein  29.95 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1758  YcgR family protein  27.2 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6362  YcgR family protein  26.87 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3035  YcgR family protein  26.37 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3345  hypothetical protein  26.24 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0287  hypothetical protein  26.24 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0275  hypothetical protein  26.24 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2090  hypothetical protein  26.24 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3003  hypothetical protein  26.24 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551391  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3016  YcgR family protein  26.37 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0561484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2402  YcgR  26.37 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3334  hypothetical protein  26.24 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0472  YcgR protein superfamily protein  26.24 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2358  YcgR family protein  26.77 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2031  YcgR family protein  25.94 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3011  YcgR family protein  25.63 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2856  type IV pilus assembly PilZ  27.04 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535348  normal  0.192411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2567  YcgR family protein  24.64 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20700  putative glycosyltransferase  23.48 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1777  type IV pilus assembly protein PilZ  23.71 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0920  hypothetical protein  25.41 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2862  glycosyltransferase-like protein  25.37 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4257  hypothetical protein  21.3 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>