42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1014 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1014  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 251 aa  500  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2862  glycosyltransferase-like protein  53.3 
 
 		 229 aa  235  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5312  YcgR  28.52 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2895  type IV pilus assembly PilZ  27.89 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.483653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00049  type IV pilus assembly protein PilZ  28.39 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1606  YcgR  25.51 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5917  putative YcgR-like protein; putative protein involved in flagellar function  26.96 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.73115 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2894  type IV pilus assembly PilZ  28.94 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.893186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1850  YcgR family protein  26.84 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0777  YcgR  28.91 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0149  hypothetical protein  30.86 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.554596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0896  putative YcgR-like protein  35.42 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.74738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2567  YcgR family protein  25.96 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1597  hypothetical protein  26.25 
 
 		 255 aa  52  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.916917 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3345  hypothetical protein  29.29 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3334  hypothetical protein  29.29 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0275  hypothetical protein  29.29 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2090  hypothetical protein  29.29 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0287  hypothetical protein  29.29 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3003  hypothetical protein  29.29 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551391  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0249  YcgR protein superfamily protein  28.87 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0472  YcgR protein superfamily protein  29.29 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3061  YcgR family protein  27.57 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2926  YcgR family protein  27.57 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3785  YcgR family protein  34.04 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4582  YcgR family protein  32.73 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3338  YcgR  23.24 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6362  YcgR family protein  27.16 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2316  YcgR family protein  25.1 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3011  YcgR family protein  26.81 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3016  YcgR family protein  27.16 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0561484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2402  YcgR  27.16 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3035  YcgR family protein  27.16 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2214  YcgR family protein  24.88 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1520  YcgR family protein  21.68 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2957  YcgR family protein  26.2 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1940  YcgR family protein  21.68 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.426731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1936  YcgR family protein  21.68 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.447296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2358  YcgR family protein  22.32 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0156  type IV pilus assembly PilZ  30.86 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4257  hypothetical protein  24.89 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2031  YcgR family protein  29.25 
 
 		 254 aa  42  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>