62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2358 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_2358  YcgR family protein  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1335  YcgR family protein  73.14 
 
 		 244 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0341188  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1936  YcgR family protein  72.31 
 
 		 244 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.447296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1996  hypothetical protein  72.73 
 
 		 244 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1940  YcgR family protein  72.73 
 
 		 244 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.426731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1520  YcgR family protein  73.14 
 
 		 244 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1954  putative type IV pilus assembly protein PilZ  69.01 
 
 		 244 aa  358  5e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.165667  normal  0.123156 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01179  hypothetical protein  68.18 
 
 		 244 aa  354  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.507814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2431  YcgR family protein  68.18 
 
 		 244 aa  354  5.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517403  normal  0.384993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01169  YcgR  68.18 
 
 		 244 aa  354  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2454  YcgR family protein  68.18 
 
 		 244 aa  354  5.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00258374  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1352  putative type IV pilus assembly protein PilZ  68.18 
 
 		 244 aa  354  8.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1339  putative type IV pilus assembly protein PilZ  68.18 
 
 		 244 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.905836  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1297  putative type IV pilus assembly protein PilZ  68.18 
 
 		 244 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396022  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3148  pilZ family protein  41.46 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.337895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3286  YcgR family protein  41.25 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3299  hypothetical protein  40.83 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0132332  normal  0.0732799 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1758  YcgR family protein  42.32 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2214  YcgR family protein  42.04 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2031  YcgR family protein  41.08 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2316  YcgR family protein  37.7 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2567  YcgR family protein  32.44 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0249  YcgR protein superfamily protein  34.43 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3011  YcgR family protein  32.34 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3785  YcgR family protein  33.62 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0149  hypothetical protein  32.76 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.554596 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6362  YcgR family protein  31.49 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3035  YcgR family protein  31.49 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2402  YcgR  31.49 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3016  YcgR family protein  31.49 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0561484  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3345  hypothetical protein  32.78 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3334  hypothetical protein  32.78 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0472  YcgR protein superfamily protein  32.78 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3003  hypothetical protein  32.78 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551391  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0287  hypothetical protein  32.78 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0275  hypothetical protein  32.78 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2090  hypothetical protein  32.78 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2926  YcgR family protein  30.64 
 
 		 251 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2957  YcgR family protein  33.62 
 
 		 249 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3061  YcgR family protein  30.64 
 
 		 251 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4582  YcgR family protein  30.84 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0896  putative YcgR-like protein  30.17 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.74738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2895  type IV pilus assembly PilZ  27.27 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.483653  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5312  YcgR  26.7 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1681  YcgR family protein  86.05 
 
 		 51 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000581039  normal  0.380637 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5917  putative YcgR-like protein; putative protein involved in flagellar function  26.46 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.73115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1850  YcgR family protein  26.86 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184522 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1606  YcgR  26.77 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3338  YcgR  26.47 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035221 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00049  type IV pilus assembly protein PilZ  24.18 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1211  glycosyltransferase-like protein  25.78 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2856  type IV pilus assembly PilZ  25.64 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535348  normal  0.192411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2894  type IV pilus assembly PilZ  22.01 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.893186  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1597  hypothetical protein  24.68 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.916917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0777  YcgR  23.67 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101382 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0022  type IV pilus assembly PilZ  26.19 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000212001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0022  type IV pilus assembly PilZ  26.19 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2862  glycosyltransferase-like protein  22.71 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1014  type IV pilus assembly PilZ  22.32 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1857  type IV pilus assembly PilZ  24.24 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1777  type IV pilus assembly protein PilZ  25.62 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4397  type IV pilus assembly PilZ  24.18 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>