19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4257 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4257  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1923  hypothetical protein  71.49 
 
 		 248 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.442768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3490  hypothetical protein  71.9 
 
 		 248 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3738  type IV pilus assembly PilZ  70.95 
 
 		 247 aa  357  7e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146635  normal  0.808645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3958  type IV pilus assembly PilZ  69.39 
 
 		 247 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1457  type IV pilus assembly PilZ  70.54 
 
 		 247 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4397  type IV pilus assembly PilZ  69.39 
 
 		 247 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2856  type IV pilus assembly PilZ  55.74 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535348  normal  0.192411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20700  putative glycosyltransferase  55.46 
 
 		 263 aa  278  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1777  type IV pilus assembly protein PilZ  53.28 
 
 		 251 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1211  glycosyltransferase-like protein  27.53 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2895  type IV pilus assembly PilZ  25.11 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.483653  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0920  hypothetical protein  22.84 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2957  YcgR family protein  24.45 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27860  Metal-dependent phosphohydrolase, HD domain protein  30.33 
 
 		 563 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2541  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 		 588 aa  43.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1606  YcgR  21.3 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017859  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1014  type IV pilus assembly PilZ  24.89 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4582  YcgR family protein  26.09 
 
 		 257 aa  42  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000154259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>