17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1923 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1923  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  510  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.442768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3490  hypothetical protein  93.15 
 
 		 248 aa  480  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3738  type IV pilus assembly PilZ  73.44 
 
 		 247 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146635  normal  0.808645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4257  hypothetical protein  71.49 
 
 		 244 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1457  type IV pilus assembly PilZ  71.78 
 
 		 247 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4397  type IV pilus assembly PilZ  72.2 
 
 		 247 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3958  type IV pilus assembly PilZ  71.78 
 
 		 247 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20700  putative glycosyltransferase  59.58 
 
 		 263 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2856  type IV pilus assembly PilZ  57.85 
 
 		 249 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535348  normal  0.192411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1777  type IV pilus assembly protein PilZ  57.09 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1211  glycosyltransferase-like protein  26.96 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0920  hypothetical protein  24.45 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27860  Metal-dependent phosphohydrolase, HD domain protein  30.3 
 
 		 563 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2567  YcgR family protein  26.55 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2957  YcgR family protein  23.68 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4582  YcgR family protein  24.68 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1850  YcgR family protein  21.72 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>