22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3738 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3738  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 247 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146635  normal  0.808645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3958  type IV pilus assembly PilZ  92.71 
 
 		 247 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1457  type IV pilus assembly PilZ  92.31 
 
 		 247 aa  480  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4397  type IV pilus assembly PilZ  91.09 
 
 		 247 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1923  hypothetical protein  73.44 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.442768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3490  hypothetical protein  74.27 
 
 		 248 aa  374  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4257  hypothetical protein  70.95 
 
 		 244 aa  357  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20700  putative glycosyltransferase  56.33 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2856  type IV pilus assembly PilZ  56.56 
 
 		 249 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535348  normal  0.192411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1777  type IV pilus assembly protein PilZ  55.74 
 
 		 251 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1211  glycosyltransferase-like protein  28.79 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4582  YcgR family protein  25.76 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27860  Metal-dependent phosphohydrolase, HD domain protein  28.97 
 
 		 563 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0920  hypothetical protein  23.38 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2957  YcgR family protein  24.56 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2567  YcgR family protein  26.96 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0896  putative YcgR-like protein  23.58 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.74738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1520  YcgR family protein  23.21 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1850  YcgR family protein  22.69 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184522 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1936  YcgR family protein  22.78 
 
 		 244 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.447296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1940  YcgR family protein  22.78 
 
 		 244 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.426731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2541  metal dependent phosphohydrolase  23.12 
 
 		 588 aa  42  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>