18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3490 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3490  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1923  hypothetical protein  93.15 
 
 		 248 aa  480  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.442768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3738  type IV pilus assembly PilZ  74.27 
 
 		 247 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146635  normal  0.808645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4397  type IV pilus assembly PilZ  73.44 
 
 		 247 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4257  hypothetical protein  71.9 
 
 		 244 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3958  type IV pilus assembly PilZ  72.61 
 
 		 247 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1457  type IV pilus assembly PilZ  73.03 
 
 		 247 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20700  putative glycosyltransferase  59.58 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1777  type IV pilus assembly protein PilZ  57.09 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2856  type IV pilus assembly PilZ  57.44 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535348  normal  0.192411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1211  glycosyltransferase-like protein  27.09 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27860  Metal-dependent phosphohydrolase, HD domain protein  32.17 
 
 		 563 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0920  hypothetical protein  25.89 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2567  YcgR family protein  28.57 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4582  YcgR family protein  26.07 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0896  putative YcgR-like protein  26.41 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.74738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2957  YcgR family protein  24.57 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2541  metal dependent phosphohydrolase  22.56 
 
 		 588 aa  42  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>