24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1777 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1777  type IV pilus assembly protein PilZ  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20700  putative glycosyltransferase  92.03 
 
 		 263 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2856  type IV pilus assembly PilZ  59.44 
 
 		 249 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535348  normal  0.192411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1923  hypothetical protein  57.09 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.442768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3490  hypothetical protein  57.09 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1457  type IV pilus assembly PilZ  56.15 
 
 		 247 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3958  type IV pilus assembly PilZ  56.15 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4397  type IV pilus assembly PilZ  56.15 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3738  type IV pilus assembly PilZ  55.74 
 
 		 247 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146635  normal  0.808645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4257  hypothetical protein  53.28 
 
 		 244 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1211  glycosyltransferase-like protein  29.6 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4582  YcgR family protein  28.51 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0920  hypothetical protein  28.28 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27860  Metal-dependent phosphohydrolase, HD domain protein  27.07 
 
 		 563 aa  52  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1606  YcgR  23.71 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017859  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2895  type IV pilus assembly PilZ  26.42 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.483653  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0896  putative YcgR-like protein  26.72 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.74738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2567  YcgR family protein  28.23 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2541  metal dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 		 588 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  29.63 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2316  YcgR family protein  32.23 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2358  YcgR family protein  25.62 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1335  YcgR family protein  22.78 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0341188  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1996  hypothetical protein  21.52 
 
 		 244 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>