26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20700 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_20700  putative glycosyltransferase  100 
 
 		 263 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1777  type IV pilus assembly protein PilZ  92.03 
 
 		 251 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2856  type IV pilus assembly PilZ  60.24 
 
 		 249 aa  322  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535348  normal  0.192411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1923  hypothetical protein  59.58 
 
 		 248 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.442768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3490  hypothetical protein  59.58 
 
 		 248 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1457  type IV pilus assembly PilZ  56.73 
 
 		 247 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3958  type IV pilus assembly PilZ  56.73 
 
 		 247 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4397  type IV pilus assembly PilZ  56.33 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3738  type IV pilus assembly PilZ  56.33 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146635  normal  0.808645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4257  hypothetical protein  55.46 
 
 		 244 aa  278  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1211  glycosyltransferase-like protein  30.04 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2895  type IV pilus assembly PilZ  27.68 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.483653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1606  YcgR  23.48 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0920  hypothetical protein  25.65 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27860  Metal-dependent phosphohydrolase, HD domain protein  26.32 
 
 		 563 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2567  YcgR family protein  28.08 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4582  YcgR family protein  27.47 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0777  YcgR  23.79 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2894  type IV pilus assembly PilZ  26.03 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.893186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2541  metal dependent phosphohydrolase  24.65 
 
 		 588 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1335  YcgR family protein  23.21 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0341188  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00049  type IV pilus assembly protein PilZ  23.24 
 
 		 265 aa  42.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1996  hypothetical protein  21.94 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3011  YcgR family protein  21.69 
 
 		 251 aa  42  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1850  YcgR family protein  22.95 
 
 		 257 aa  42  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0896  putative YcgR-like protein  25.54 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.74738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>