24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3958 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3958  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 247 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1457  type IV pilus assembly PilZ  98.79 
 
 		 247 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4397  type IV pilus assembly PilZ  97.57 
 
 		 247 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.822283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3738  type IV pilus assembly PilZ  92.71 
 
 		 247 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146635  normal  0.808645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1923  hypothetical protein  71.78 
 
 		 248 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.442768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3490  hypothetical protein  72.61 
 
 		 248 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.291919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4257  hypothetical protein  69.39 
 
 		 244 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20700  putative glycosyltransferase  56.73 
 
 		 263 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2856  type IV pilus assembly PilZ  56.56 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535348  normal  0.192411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1777  type IV pilus assembly protein PilZ  56.15 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1211  glycosyltransferase-like protein  28.24 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27860  Metal-dependent phosphohydrolase, HD domain protein  29.66 
 
 		 563 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4582  YcgR family protein  23.58 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0920  hypothetical protein  23.83 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1520  YcgR family protein  24.05 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2957  YcgR family protein  23.25 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2567  YcgR family protein  26.09 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1936  YcgR family protein  23.63 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.447296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1940  YcgR family protein  23.63 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.426731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1996  hypothetical protein  23.63 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1335  YcgR family protein  23.63 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0341188  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3299  hypothetical protein  27.43 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0132332  normal  0.0732799 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3286  YcgR family protein  27.43 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3148  pilZ family protein  27.43 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.337895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>