57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3286 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3286  YcgR family protein  100 
 
 		 252 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3299  hypothetical protein  99.21 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0132332  normal  0.0732799 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3148  pilZ family protein  99.6 
 
 		 249 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.337895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2031  YcgR family protein  51.2 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1758  YcgR family protein  50.4 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2214  YcgR family protein  43.87 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2316  YcgR family protein  43.6 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1936  YcgR family protein  44.49 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.447296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1520  YcgR family protein  44.08 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1335  YcgR family protein  44.08 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0341188  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1996  hypothetical protein  44.08 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1940  YcgR family protein  44.08 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.426731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1339  putative type IV pilus assembly protein PilZ  41.49 
 
 		 244 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.905836  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1297  putative type IV pilus assembly protein PilZ  41.49 
 
 		 244 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1352  putative type IV pilus assembly protein PilZ  41.49 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01179  hypothetical protein  41.08 
 
 		 244 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.507814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2431  YcgR family protein  41.08 
 
 		 244 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517403  normal  0.384993 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2454  YcgR family protein  41.08 
 
 		 244 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00258374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01169  YcgR  41.08 
 
 		 244 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1954  putative type IV pilus assembly protein PilZ  41.08 
 
 		 244 aa  197  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.165667  normal  0.123156 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2358  YcgR family protein  41.25 
 
 		 243 aa  195  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0249  YcgR protein superfamily protein  34.16 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3035  YcgR family protein  33.05 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3016  YcgR family protein  33.05 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0561484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2402  YcgR  33.05 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6362  YcgR family protein  32.64 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3011  YcgR family protein  33.47 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0275  hypothetical protein  33.61 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3334  hypothetical protein  33.61 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0472  YcgR protein superfamily protein  33.61 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3345  hypothetical protein  33.61 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0287  hypothetical protein  33.61 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3003  hypothetical protein  33.61 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551391  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2090  hypothetical protein  33.61 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4582  YcgR family protein  34.32 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0149  hypothetical protein  32.11 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.554596 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3785  YcgR family protein  33.47 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3061  YcgR family protein  31.8 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2926  YcgR family protein  31.8 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0896  putative YcgR-like protein  33.9 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.74738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2957  YcgR family protein  30.36 
 
 		 249 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2567  YcgR family protein  30.08 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5312  YcgR  25.63 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5917  putative YcgR-like protein; putative protein involved in flagellar function  26.27 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.73115 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1606  YcgR  25.93 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3338  YcgR  30 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035221 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2895  type IV pilus assembly PilZ  26.1 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.483653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00049  type IV pilus assembly protein PilZ  23.14 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0777  YcgR  22.82 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2894  type IV pilus assembly PilZ  23.83 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.893186  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1597  hypothetical protein  29.17 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.916917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1850  YcgR family protein  21.14 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184522 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1681  YcgR family protein  51.11 
 
 		 51 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000581039  normal  0.380637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1211  glycosyltransferase-like protein  21.63 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3958  type IV pilus assembly PilZ  27.43 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2205  extracellular ligand-binding receptor  29.73 
 
 		 418 aa  42.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1457  type IV pilus assembly PilZ  27.43 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>