18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1681 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1681  YcgR family protein  100 
 
 		 51 aa  102  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000581039  normal  0.380637 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2454  YcgR family protein  100 
 
 		 244 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00258374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01179  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.507814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2431  YcgR family protein  100 
 
 		 244 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517403  normal  0.384993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01169  YcgR  100 
 
 		 244 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1297  putative type IV pilus assembly protein PilZ  100 
 
 		 244 aa  92  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1339  putative type IV pilus assembly protein PilZ  100 
 
 		 244 aa  92  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.905836  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1352  putative type IV pilus assembly protein PilZ  97.78 
 
 		 244 aa  90.5  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1954  putative type IV pilus assembly protein PilZ  97.78 
 
 		 244 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.165667  normal  0.123156 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1996  hypothetical protein  88.89 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1335  YcgR family protein  88.89 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0341188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1520  YcgR family protein  88.89 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1936  YcgR family protein  86.67 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.447296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1940  YcgR family protein  86.67 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.426731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2358  YcgR family protein  86.05 
 
 		 243 aa  77.4  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3286  YcgR family protein  51.11 
 
 		 252 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3148  pilZ family protein  51.11 
 
 		 249 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.337895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3299  hypothetical protein  48.89 
 
 		 252 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0132332  normal  0.0732799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>