42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2862 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2862  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 229 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1014  type IV pilus assembly PilZ  53.3 
 
 		 251 aa  235  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2894  type IV pilus assembly PilZ  27.88 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.893186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00049  type IV pilus assembly protein PilZ  26.34 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5312  YcgR  25.34 
 
 		 265 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5917  putative YcgR-like protein; putative protein involved in flagellar function  27.56 
 
 		 264 aa  71.6  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.73115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3338  YcgR  29.81 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0249  YcgR protein superfamily protein  31.43 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2957  YcgR family protein  33.95 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0472  YcgR protein superfamily protein  31.48 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3003  hypothetical protein  31.48 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551391  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2090  hypothetical protein  31.48 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0275  hypothetical protein  31.48 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0287  hypothetical protein  31.48 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3345  hypothetical protein  31.48 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3334  hypothetical protein  31.48 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1597  hypothetical protein  24.79 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.916917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2895  type IV pilus assembly PilZ  24.43 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.483653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1850  YcgR family protein  27.71 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184522 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1606  YcgR  25.37 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017859  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3061  YcgR family protein  32.62 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2926  YcgR family protein  32.62 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3011  YcgR family protein  33.33 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1335  YcgR family protein  24.89 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0341188  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1996  hypothetical protein  24.89 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0777  YcgR  25.21 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101382 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6362  YcgR family protein  33.33 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1520  YcgR family protein  25.86 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3035  YcgR family protein  33.33 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3016  YcgR family protein  33.33 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0561484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2402  YcgR  33.33 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2316  YcgR family protein  25.94 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1936  YcgR family protein  25.86 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.447296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1940  YcgR family protein  25.86 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.426731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0149  hypothetical protein  32.14 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.554596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2358  YcgR family protein  22.71 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3785  YcgR family protein  30.43 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4582  YcgR family protein  27.67 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2567  YcgR family protein  26.19 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0896  putative YcgR-like protein  28.3 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.74738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1857  type IV pilus assembly PilZ  24.42 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00785835  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2214  YcgR family protein  24.77 
 
 		 252 aa  41.6  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>