42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1440 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1440  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 460 aa  929    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0770116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  28.19 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1052 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  27.36 
 
 		 597 aa  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  24.76 
 
 		 561 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  25.12 
 
 		 558 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  24.19 
 
 		 559 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  24.19 
 
 		 559 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  25.12 
 
 		 558 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  25.12 
 
 		 558 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  25.12 
 
 		 558 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  23.79 
 
 		 557 aa  47.4  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.29 
 
 		 415 aa  46.6  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  29.06 
 
 		 555 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  29.06 
 
 		 555 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  29.91 
 
 		 555 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  29.06 
 
 		 555 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  27.59 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  29.06 
 
 		 555 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1379  RNA binding S1 domain protein  23.21 
 
 		 552 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566824  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  29.06 
 
 		 555 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  29.06 
 
 		 555 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  29.06 
 
 		 555 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  25.26 
 
 		 559 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  33 
 
 		 556 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3642  30S ribosomal protein S1  24.27 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0546866  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  24.27 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  29.06 
 
 		 555 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  25 
 
 		 557 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  29.06 
 
 		 555 aa  45.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  28.68 
 
 		 555 aa  44.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0061  RNA binding S1 domain protein  22.7 
 
 		 525 aa  44.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  28.21 
 
 		 555 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  26.9 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  28.57 
 
 		 400 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  28.69 
 
 		 558 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  24.62 
 
 		 593 aa  43.5  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  28.21 
 
 		 555 aa  43.5  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  30.56 
 
 		 598 aa  43.5  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2298  30S ribosomal protein S1  28.21 
 
 		 555 aa  43.1  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000879863  unclonable  0.000000000196055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  24.14 
 
 		 560 aa  43.1  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  23.3 
 
 		 563 aa  43.1  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>