120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2147 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2147  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257138  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2571  hypothetical protein  48.21 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0780  hypothetical protein  49.7 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912391  normal  0.0586542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1560  hypothetical protein  52.2 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1672  hypothetical protein  47.9 
 
 		 205 aa  151  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0583  hypothetical protein  48.05 
 
 		 180 aa  150  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0402965  normal  0.143572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0944  hypothetical protein  49.38 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.0275121 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2955  hypothetical protein  47.85 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2846  hypothetical protein  47.85 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.913933  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2906  hypothetical protein  47.85 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2223  hypothetical protein  47.09 
 
 		 203 aa  147  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0390  hypothetical protein  47.24 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2533  hypothetical protein  47.24 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.914076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0906  hypothetical protein  47.24 
 
 		 202 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0241  hypothetical protein  47.24 
 
 		 202 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0886  hypothetical protein  45.56 
 
 		 208 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0815  hypothetical protein  45.56 
 
 		 208 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2966  hypothetical protein  46.84 
 
 		 204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119869  normal  0.461919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1018  hypothetical protein  46.84 
 
 		 203 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0352  hypothetical protein  48.72 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0596  hypothetical protein  48.08 
 
 		 179 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4194  hypothetical protein  47.24 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0956  hypothetical protein  47.2 
 
 		 203 aa  141  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0960  hypothetical protein  47.2 
 
 		 200 aa  141  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1052  hypothetical protein  45.03 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0970  protein of unknown function DUF615  45.03 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0910  hypothetical protein  44.58 
 
 		 203 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0601  hypothetical protein  46.58 
 
 		 203 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1080  hypothetical protein  46.58 
 
 		 203 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1039  hypothetical protein  46.58 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2414  hypothetical protein  44.3 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31383  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2116  hypothetical protein  46.45 
 
 		 193 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2322  hypothetical protein  41.76 
 
 		 225 aa  131  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0300242  normal  0.462605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3184  hypothetical protein  41.86 
 
 		 178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2233  hypothetical protein  42.5 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3288  hypothetical protein  43.4 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1222  hypothetical protein  39.88 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2078  hypothetical protein  41.67 
 
 		 220 aa  124  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0941  hypothetical protein  42.77 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.607933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0981  hypothetical protein  42.77 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4274  hypothetical protein  43.4 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.171869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1237  protein of unknown function DUF615  41.98 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58060  hypothetical protein  44.38 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0123622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1384  hypothetical protein  44.38 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00400035  normal  0.0106764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0864  hypothetical protein  46.36 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2897  hypothetical protein  42.5 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1326  hypothetical protein  45.1 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12730  hypothetical protein  45.68 
 
 		 172 aa  121  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2721  hypothetical protein  42.86 
 
 		 174 aa  120  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949713  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1170  hypothetical protein  47.02 
 
 		 182 aa  120  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0143293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0948  hypothetical protein  42.14 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0846  hypothetical protein  47.5 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512108  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0425  hypothetical protein  46.36 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0489  hypothetical protein  46.36 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03672  hypothetical protein  44.38 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0864  hypothetical protein  43.33 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5087  hypothetical protein  43.12 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01892  hypothetical protein  41.61 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002396  putative alpha helix protein  43.75 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3553  protein of unknown function DUF615  43.56 
 
 		 218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2888  hypothetical protein  42.07 
 
 		 204 aa  117  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3822  hypothetical protein  43.27 
 
 		 182 aa  118  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4464  hypothetical protein  44.3 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000293332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4155  hypothetical protein  44.3 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4387  hypothetical protein  45.7 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0274  hypothetical protein  45.03 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.649245  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0266  hypothetical protein  44.37 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3068  hypothetical protein  40.99 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0511  hypothetical protein  40.61 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0532  hypothetical protein  40.61 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.993858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1911  hypothetical protein  44 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  unclonable  0.00000673903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1335  hypothetical protein  38.82 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.154229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4260  hypothetical protein  42.07 
 
 		 236 aa  111  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.541148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0593  hypothetical protein  41.57 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3806  hypothetical protein  41.57 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2422  hypothetical protein  41.94 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.946472  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0537  hypothetical protein  41.57 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2837  hypothetical protein  38.86 
 
 		 208 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.665856  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0022  hypothetical protein  39.61 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3456  hypothetical protein  38.18 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0494  hypothetical protein  38.18 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3632  hypothetical protein  38.18 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4079  hypothetical protein  37.29 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0021  hypothetical protein  39.61 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0473  hypothetical protein  38.46 
 
 		 189 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.353455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0491  hypothetical protein  43.05 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3664  hypothetical protein  43.05 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0413  hypothetical protein  37.82 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.229359  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0481  hypothetical protein  39.16 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.275337 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2265  protein of unknown function DUF615  43.71 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1238  hypothetical protein  36.18 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2013  hypothetical protein  36.14 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0192  hypothetical protein  37.79 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0148149  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2083  protein of unknown function DUF615  39.35 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.363472  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4782  hypothetical protein  41.06 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4837  hypothetical protein  41.06 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4687  hypothetical protein  41.06 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.67161  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4719  hypothetical protein  41.06 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.68666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4817  hypothetical protein  41.06 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3722  hypothetical protein  37.27 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000177503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>