121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0192 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0192  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  350  7e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0148149  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00272  hypothetical protein  51.2 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1170  hypothetical protein  52.15 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0143293 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0425  hypothetical protein  51.22 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0489  hypothetical protein  51.22 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2116  hypothetical protein  50.32 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4817  hypothetical protein  53.29 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4782  hypothetical protein  53.29 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4837  hypothetical protein  53.29 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4687  hypothetical protein  53.29 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.67161  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4719  hypothetical protein  53.29 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.68666  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04102  hypothetical protein  53.29 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3760  protein of unknown function DUF615  53.29 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04066  hypothetical protein  53.29 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4487  hypothetical protein  53.29 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4804  hypothetical protein  53.29 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5753  hypothetical protein  53.29 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3777  hypothetical protein  53.29 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4712  hypothetical protein  53.29 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4850  hypothetical protein  53.29 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3822  hypothetical protein  48.19 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4387  hypothetical protein  49.08 
 
 		 182 aa  147  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3664  hypothetical protein  48.8 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0266  hypothetical protein  51.97 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0421  hypothetical protein  50.66 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0274  hypothetical protein  51.97 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.649245  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002396  putative alpha helix protein  46.78 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03672  hypothetical protein  46.2 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1326  hypothetical protein  47.88 
 
 		 177 aa  140  7e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3456  hypothetical protein  42.86 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0494  hypothetical protein  42.29 
 
 		 177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3632  hypothetical protein  42.29 
 
 		 177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4079  hypothetical protein  41.71 
 
 		 177 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3068  hypothetical protein  42.86 
 
 		 177 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0593  hypothetical protein  44.65 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0511  hypothetical protein  44.03 
 
 		 178 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0532  hypothetical protein  44.03 
 
 		 178 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.993858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0537  hypothetical protein  44.03 
 
 		 178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3806  hypothetical protein  44.03 
 
 		 178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0491  hypothetical protein  45.39 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1131  hypothetical protein  44.17 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0187042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3722  hypothetical protein  40 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000177503  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0583  hypothetical protein  42.51 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0402965  normal  0.143572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5087  hypothetical protein  42.51 
 
 		 174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58060  hypothetical protein  41.92 
 
 		 200 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0123622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0864  hypothetical protein  39.29 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4274  hypothetical protein  41.03 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.171869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12730  hypothetical protein  41.29 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0948  hypothetical protein  41.03 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0481  hypothetical protein  37.99 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.275337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0941  hypothetical protein  41.03 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.607933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0981  hypothetical protein  41.03 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4389  hypothetical protein  38.2 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0571  hypothetical protein  36.52 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.310055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4552  hypothetical protein  35.95 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0846  hypothetical protein  41.29 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512108  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0886  hypothetical protein  41.1 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0960  hypothetical protein  40.38 
 
 		 200 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0815  hypothetical protein  41.1 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0956  hypothetical protein  40.38 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0944  hypothetical protein  40.74 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.0275121 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4155  hypothetical protein  40.88 
 
 		 173 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4464  hypothetical protein  40.88 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000293332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4194  hypothetical protein  39.74 
 
 		 204 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2233  hypothetical protein  37.66 
 
 		 175 aa  104  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305733  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0601  hypothetical protein  39.74 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1080  hypothetical protein  39.74 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1039  hypothetical protein  39.74 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3184  hypothetical protein  37.01 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1018  hypothetical protein  37.74 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3741  hypothetical protein  34.27 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2013  hypothetical protein  37.91 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2223  hypothetical protein  38.46 
 
 		 203 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2966  hypothetical protein  37.74 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119869  normal  0.461919 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0390  hypothetical protein  37.82 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2533  hypothetical protein  37.82 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.914076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2955  hypothetical protein  37.82 
 
 		 202 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2571  hypothetical protein  36.14 
 
 		 202 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2846  hypothetical protein  37.82 
 
 		 202 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.913933  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2906  hypothetical protein  37.82 
 
 		 199 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0906  hypothetical protein  37.82 
 
 		 202 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0241  hypothetical protein  37.82 
 
 		 202 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2147  hypothetical protein  37.79 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257138  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1672  hypothetical protein  37.18 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0910  hypothetical protein  36.42 
 
 		 203 aa  97.1  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01892  hypothetical protein  37.66 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0021  hypothetical protein  37.34 
 
 		 159 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0022  hypothetical protein  36.71 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2414  hypothetical protein  40.65 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31383  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0415  hypothetical protein  38.98 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0352  hypothetical protein  38.96 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0780  hypothetical protein  35.9 
 
 		 193 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912391  normal  0.0586542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2422  hypothetical protein  38.95 
 
 		 179 aa  94.4  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.946472  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1238  hypothetical protein  32.94 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001561  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3288  hypothetical protein  38.99 
 
 		 196 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1222  hypothetical protein  35.5 
 
 		 217 aa  92.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0864  hypothetical protein  35 
 
 		 182 aa  91.7  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1560  hypothetical protein  42.76 
 
 		 197 aa  91.3  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1911  hypothetical protein  38.22 
 
 		 161 aa  90.9  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  unclonable  0.00000673903 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1237  protein of unknown function DUF615  37.65 
 
 		 190 aa  90.9  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>