121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0910 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0910  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2571  hypothetical protein  79.31 
 
 		 202 aa  323  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0944  hypothetical protein  59.2 
 
 		 208 aa  234  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.0275121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0886  hypothetical protein  55.29 
 
 		 208 aa  224  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0815  hypothetical protein  55.29 
 
 		 208 aa  224  8e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1672  hypothetical protein  59 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0906  hypothetical protein  61.41 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0241  hypothetical protein  61.41 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0780  hypothetical protein  62.5 
 
 		 193 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912391  normal  0.0586542 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0390  hypothetical protein  61.33 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2533  hypothetical protein  61.33 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.914076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2955  hypothetical protein  61.33 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2906  hypothetical protein  61.33 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2223  hypothetical protein  58.7 
 
 		 203 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0601  hypothetical protein  58.7 
 
 		 203 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1080  hypothetical protein  58.7 
 
 		 203 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1039  hypothetical protein  58.7 
 
 		 204 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2846  hypothetical protein  61.33 
 
 		 202 aa  197  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.913933  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0956  hypothetical protein  57.07 
 
 		 203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4194  hypothetical protein  57.61 
 
 		 204 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1018  hypothetical protein  58.29 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0960  hypothetical protein  56.91 
 
 		 200 aa  191  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2966  hypothetical protein  56.76 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119869  normal  0.461919 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0352  hypothetical protein  45.51 
 
 		 175 aa  147  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0583  hypothetical protein  44.87 
 
 		 180 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0402965  normal  0.143572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0970  protein of unknown function DUF615  47.06 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12071  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2147  hypothetical protein  44.58 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257138  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1052  hypothetical protein  46.47 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1560  hypothetical protein  44.44 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1222  hypothetical protein  43.86 
 
 		 217 aa  127  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3288  hypothetical protein  44.79 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3553  protein of unknown function DUF615  44.1 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2078  hypothetical protein  43.53 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2322  hypothetical protein  42.26 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0300242  normal  0.462605 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01892  hypothetical protein  41.82 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4260  hypothetical protein  38.86 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.541148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1384  hypothetical protein  43.37 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00400035  normal  0.0106764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2897  hypothetical protein  43.31 
 
 		 196 aa  121  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0596  hypothetical protein  41.45 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2837  hypothetical protein  42.94 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.665856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4274  hypothetical protein  42.33 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.171869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2414  hypothetical protein  40.48 
 
 		 182 aa  118  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2233  hypothetical protein  41.88 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305733  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12730  hypothetical protein  41.46 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2721  hypothetical protein  41.14 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949713  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1237  protein of unknown function DUF615  39.64 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0941  hypothetical protein  41.1 
 
 		 173 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.607933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0981  hypothetical protein  41.1 
 
 		 173 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2888  hypothetical protein  38.41 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0948  hypothetical protein  41.1 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3184  hypothetical protein  39.02 
 
 		 178 aa  111  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4155  hypothetical protein  39.88 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4464  hypothetical protein  39.88 
 
 		 173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000293332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0846  hypothetical protein  38.99 
 
 		 179 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512108  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0864  hypothetical protein  39.02 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0413  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.229359  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5087  hypothetical protein  39.75 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58060  hypothetical protein  39.75 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0123622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0473  hypothetical protein  36.02 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.353455  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1326  hypothetical protein  38.56 
 
 		 177 aa  105  6e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2116  hypothetical protein  39.1 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0022  hypothetical protein  42.59 
 
 		 159 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1911  hypothetical protein  41.4 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  unclonable  0.00000673903 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3822  hypothetical protein  39.22 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0021  hypothetical protein  41.98 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0491  hypothetical protein  39.38 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0425  hypothetical protein  37.91 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4817  hypothetical protein  39.87 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4387  hypothetical protein  38.56 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1170  hypothetical protein  37.91 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0143293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0489  hypothetical protein  37.91 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4782  hypothetical protein  39.87 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4837  hypothetical protein  39.87 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4687  hypothetical protein  39.87 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.67161  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4719  hypothetical protein  39.87 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.68666  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2422  hypothetical protein  38.65 
 
 		 179 aa  98.6  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.946472  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00272  hypothetical protein  34.76 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0864  hypothetical protein  35.37 
 
 		 182 aa  97.8  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0192  hypothetical protein  36.42 
 
 		 175 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0148149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2013  hypothetical protein  33.88 
 
 		 186 aa  95.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3664  hypothetical protein  38.56 
 
 		 183 aa  95.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1131  hypothetical protein  37.01 
 
 		 168 aa  95.1  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0187042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1395  hypothetical protein  39.61 
 
 		 167 aa  94.7  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284813  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04102  hypothetical protein  38.56 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3760  protein of unknown function DUF615  38.56 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5753  hypothetical protein  38.56 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04066  hypothetical protein  38.56 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4487  hypothetical protein  38.56 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4804  hypothetical protein  38.56 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3777  hypothetical protein  38.56 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4712  hypothetical protein  38.56 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4850  hypothetical protein  38.56 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0274  hypothetical protein  35.62 
 
 		 183 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.649245  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0593  hypothetical protein  37.72 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0511  hypothetical protein  34.97 
 
 		 178 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0532  hypothetical protein  34.97 
 
 		 178 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.993858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0266  hypothetical protein  36.6 
 
 		 183 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0494  hypothetical protein  34.78 
 
 		 177 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3632  hypothetical protein  34.78 
 
 		 177 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4079  hypothetical protein  32.53 
 
 		 177 aa  92.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>