121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2571 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2571  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0910  hypothetical protein  79.31 
 
 		 203 aa  323  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0944  hypothetical protein  58.17 
 
 		 208 aa  236  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.0275121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0886  hypothetical protein  56.59 
 
 		 208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0815  hypothetical protein  56.59 
 
 		 208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1672  hypothetical protein  60.1 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0906  hypothetical protein  63.64 
 
 		 202 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0241  hypothetical protein  63.64 
 
 		 202 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2955  hypothetical protein  61.11 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2906  hypothetical protein  61.11 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2846  hypothetical protein  61.31 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.913933  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0390  hypothetical protein  63.04 
 
 		 199 aa  210  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2533  hypothetical protein  63.04 
 
 		 199 aa  210  9e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.914076  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4194  hypothetical protein  59.89 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2223  hypothetical protein  58.76 
 
 		 203 aa  207  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0601  hypothetical protein  58.38 
 
 		 203 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1080  hypothetical protein  58.38 
 
 		 203 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1039  hypothetical protein  58.38 
 
 		 204 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0956  hypothetical protein  58.15 
 
 		 203 aa  204  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0780  hypothetical protein  61.31 
 
 		 193 aa  201  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912391  normal  0.0586542 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0960  hypothetical protein  57.46 
 
 		 200 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1018  hypothetical protein  61.69 
 
 		 203 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2966  hypothetical protein  56.59 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119869  normal  0.461919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2147  hypothetical protein  48.21 
 
 		 176 aa  156  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257138  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0583  hypothetical protein  45.28 
 
 		 180 aa  147  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0402965  normal  0.143572 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0352  hypothetical protein  46.71 
 
 		 175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1560  hypothetical protein  47.85 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0970  protein of unknown function DUF615  44.85 
 
 		 220 aa  138  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1052  hypothetical protein  44.24 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3288  hypothetical protein  43.92 
 
 		 196 aa  131  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2322  hypothetical protein  41.34 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0300242  normal  0.462605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0596  hypothetical protein  43.04 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01892  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1384  hypothetical protein  42.16 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00400035  normal  0.0106764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1222  hypothetical protein  41.4 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1237  protein of unknown function DUF615  39.33 
 
 		 190 aa  121  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2414  hypothetical protein  42.14 
 
 		 182 aa  121  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3553  protein of unknown function DUF615  40.37 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2078  hypothetical protein  40.83 
 
 		 220 aa  118  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2897  hypothetical protein  41.4 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2721  hypothetical protein  41.25 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949713  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2837  hypothetical protein  40.35 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.665856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2888  hypothetical protein  37.04 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2233  hypothetical protein  40.26 
 
 		 175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305733  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4274  hypothetical protein  38.65 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.171869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12730  hypothetical protein  40 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4387  hypothetical protein  39.29 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0941  hypothetical protein  38.65 
 
 		 173 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.607933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0981  hypothetical protein  38.65 
 
 		 173 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3184  hypothetical protein  38.1 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0425  hypothetical protein  39.39 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0948  hypothetical protein  39.49 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0489  hypothetical protein  39.39 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1170  hypothetical protein  38.92 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0143293 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0864  hypothetical protein  36.9 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0846  hypothetical protein  40.26 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512108  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1395  hypothetical protein  41.25 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3822  hypothetical protein  39.52 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4260  hypothetical protein  34.45 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.541148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0274  hypothetical protein  39.38 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.649245  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0864  hypothetical protein  38.12 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4464  hypothetical protein  38.04 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000293332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4155  hypothetical protein  38.04 
 
 		 173 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5087  hypothetical protein  38.12 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2116  hypothetical protein  39.62 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1326  hypothetical protein  36.9 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58060  hypothetical protein  36.47 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0123622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0266  hypothetical protein  38.75 
 
 		 183 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0473  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  104  9e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.353455  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  104  9e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.229359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4817  hypothetical protein  40.76 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4782  hypothetical protein  40.76 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4837  hypothetical protein  40.76 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4687  hypothetical protein  40.76 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.67161  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4719  hypothetical protein  40.76 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.68666  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3664  hypothetical protein  38.69 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0494  hypothetical protein  39.05 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3632  hypothetical protein  39.05 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0593  hypothetical protein  38.55 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0022  hypothetical protein  43.31 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3456  hypothetical protein  39.05 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0511  hypothetical protein  40.59 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0532  hypothetical protein  40.59 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.993858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00272  hypothetical protein  36.22 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2422  hypothetical protein  38.95 
 
 		 179 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.946472  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1911  hypothetical protein  39.1 
 
 		 161 aa  101  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  unclonable  0.00000673903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4079  hypothetical protein  38.46 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0192  hypothetical protein  36.14 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0148149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1131  hypothetical protein  40.62 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0187042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3806  hypothetical protein  37.95 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0537  hypothetical protein  37.95 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04102  hypothetical protein  39.49 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3760  protein of unknown function DUF615  39.49 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0021  hypothetical protein  42.68 
 
 		 159 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04066  hypothetical protein  39.49 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4804  hypothetical protein  39.49 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3777  hypothetical protein  39.49 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4712  hypothetical protein  39.49 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5753  hypothetical protein  39.49 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4850  hypothetical protein  39.49 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>