120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1911 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1911  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  318  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  unclonable  0.00000673903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0583  hypothetical protein  44.59 
 
 
180 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0402965  normal  0.143572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1560  hypothetical protein  50.32 
 
 
197 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1326  hypothetical protein  45.81 
 
 
177 aa  121  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0266  hypothetical protein  45.1 
 
 
183 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0421  hypothetical protein  42.48 
 
 
183 aa  116  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3822  hypothetical protein  44.44 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0274  hypothetical protein  43.14 
 
 
183 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.649245  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2414  hypothetical protein  45.1 
 
 
182 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31383  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3664  hypothetical protein  43.14 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2147  hypothetical protein  44 
 
 
176 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257138  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4782  hypothetical protein  42.48 
 
 
183 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153029  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4837  hypothetical protein  42.48 
 
 
183 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857829  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4687  hypothetical protein  42.48 
 
 
183 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.67161  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4719  hypothetical protein  42.48 
 
 
183 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.68666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4817  hypothetical protein  42.48 
 
 
183 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4387  hypothetical protein  43.14 
 
 
182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04102  hypothetical protein  41.83 
 
 
183 aa  111  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3760  protein of unknown function DUF615  41.83 
 
 
183 aa  111  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2083  protein of unknown function DUF615  45.33 
 
 
175 aa  111  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.363472  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2013  hypothetical protein  44.23 
 
 
186 aa  111  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04066  hypothetical protein  41.83 
 
 
183 aa  111  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4487  hypothetical protein  41.83 
 
 
183 aa  111  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4804  hypothetical protein  41.83 
 
 
183 aa  111  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3777  hypothetical protein  41.83 
 
 
183 aa  111  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4712  hypothetical protein  41.83 
 
 
183 aa  111  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5753  hypothetical protein  41.83 
 
 
183 aa  111  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4850  hypothetical protein  41.83 
 
 
183 aa  111  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2265  protein of unknown function DUF615  47.65 
 
 
165 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3184  hypothetical protein  37.75 
 
 
178 aa  107  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.836007  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2116  hypothetical protein  40.67 
 
 
193 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1170  hypothetical protein  42.48 
 
 
182 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0143293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4274  hypothetical protein  40 
 
 
173 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.171869  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0425  hypothetical protein  41.83 
 
 
182 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0489  hypothetical protein  41.83 
 
 
182 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002396  putative alpha helix protein  41.29 
 
 
175 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12730  hypothetical protein  41.4 
 
 
172 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0910  hypothetical protein  41.4 
 
 
203 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03672  hypothetical protein  41.94 
 
 
174 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0944  hypothetical protein  41.29 
 
 
208 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.0275121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5087  hypothetical protein  40.13 
 
 
174 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2571  hypothetical protein  39.1 
 
 
202 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0886  hypothetical protein  42.14 
 
 
208 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0815  hypothetical protein  42.14 
 
 
208 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0941  hypothetical protein  39.35 
 
 
173 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.607933  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0981  hypothetical protein  39.35 
 
 
173 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2233  hypothetical protein  38.41 
 
 
175 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305733  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58060  hypothetical protein  39.87 
 
 
200 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0123622  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0948  hypothetical protein  38.96 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30655  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2422  hypothetical protein  38.96 
 
 
179 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.946472  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0846  hypothetical protein  39.61 
 
 
179 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512108  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0491  hypothetical protein  37.01 
 
 
179 aa  97.4  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4464  hypothetical protein  39.35 
 
 
173 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000293332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4155  hypothetical protein  39.35 
 
 
173 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1395  hypothetical protein  42.86 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284813  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0352  hypothetical protein  35.67 
 
 
175 aa  94  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0864  hypothetical protein  37.82 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2721  hypothetical protein  37.09 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949713  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3068  hypothetical protein  39.1 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0494  hypothetical protein  35.95 
 
 
177 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3632  hypothetical protein  35.95 
 
 
177 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0593  hypothetical protein  35.95 
 
 
178 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1672  hypothetical protein  40.76 
 
 
205 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3456  hypothetical protein  35.95 
 
 
177 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4079  hypothetical protein  35.29 
 
 
177 aa  90.9  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0596  hypothetical protein  36.94 
 
 
179 aa  90.9  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0192  hypothetical protein  38.22 
 
 
175 aa  90.9  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0148149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0390  hypothetical protein  39.13 
 
 
199 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2955  hypothetical protein  39.13 
 
 
202 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1131  hypothetical protein  36.13 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0187042  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2533  hypothetical protein  39.13 
 
 
199 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.914076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0906  hypothetical protein  39.13 
 
 
202 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3806  hypothetical protein  35.29 
 
 
178 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2906  hypothetical protein  39.13 
 
 
199 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0241  hypothetical protein  39.13 
 
 
202 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0537  hypothetical protein  35.29 
 
 
178 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2846  hypothetical protein  39.49 
 
 
202 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.913933  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1335  hypothetical protein  36.77 
 
 
179 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.154229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0780  hypothetical protein  39.22 
 
 
193 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912391  normal  0.0586542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00272  hypothetical protein  35.1 
 
 
185 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0511  hypothetical protein  35.29 
 
 
178 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0532  hypothetical protein  35.29 
 
 
178 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.993858  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0864  hypothetical protein  37.66 
 
 
172 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2837  hypothetical protein  38.12 
 
 
208 aa  87.4  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.665856  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4194  hypothetical protein  40 
 
 
204 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2888  hypothetical protein  34.01 
 
 
204 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0956  hypothetical protein  39.49 
 
 
203 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0960  hypothetical protein  39.49 
 
 
200 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3722  hypothetical protein  35.95 
 
 
177 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000177503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2223  hypothetical protein  39.49 
 
 
203 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3288  hypothetical protein  36.71 
 
 
196 aa  85.5  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0601  hypothetical protein  40 
 
 
203 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1080  hypothetical protein  40 
 
 
203 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1039  hypothetical protein  40 
 
 
204 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1238  hypothetical protein  33.12 
 
 
181 aa  84.3  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001561  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1384  hypothetical protein  38.06 
 
 
202 aa  84.3  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00400035  normal  0.0106764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1222  hypothetical protein  37.78 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1018  hypothetical protein  35.95 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4552  hypothetical protein  29.61 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2966  hypothetical protein  35.95 
 
 
204 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119869  normal  0.461919 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>