120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2078 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2078  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0970  protein of unknown function DUF615  78.64 
 
 
220 aa  336  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1052  hypothetical protein  78.18 
 
 
220 aa  334  5e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457164  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2322  hypothetical protein  78.92 
 
 
225 aa  327  9e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0300242  normal  0.462605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4260  hypothetical protein  66.51 
 
 
236 aa  264  7e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.541148  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3553  protein of unknown function DUF615  64.93 
 
 
218 aa  258  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2888  hypothetical protein  65.85 
 
 
204 aa  257  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3288  hypothetical protein  55.39 
 
 
196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1384  hypothetical protein  55.34 
 
 
202 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00400035  normal  0.0106764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1222  hypothetical protein  50.89 
 
 
217 aa  145  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2223  hypothetical protein  44.77 
 
 
203 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0390  hypothetical protein  42.94 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2533  hypothetical protein  42.94 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.914076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0906  hypothetical protein  42.94 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0241  hypothetical protein  42.94 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2955  hypothetical protein  43.86 
 
 
202 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2906  hypothetical protein  43.86 
 
 
199 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2846  hypothetical protein  43.86 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.913933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0780  hypothetical protein  44.19 
 
 
193 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912391  normal  0.0586542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2147  hypothetical protein  41.67 
 
 
176 aa  124  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257138  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0944  hypothetical protein  43.85 
 
 
208 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.0275121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0910  hypothetical protein  43.53 
 
 
203 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1672  hypothetical protein  42.69 
 
 
205 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2966  hypothetical protein  43.02 
 
 
204 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119869  normal  0.461919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1018  hypothetical protein  43.02 
 
 
203 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4194  hypothetical protein  43.02 
 
 
204 aa  121  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0960  hypothetical protein  42.44 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0956  hypothetical protein  42.44 
 
 
203 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0601  hypothetical protein  42.69 
 
 
203 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1080  hypothetical protein  42.69 
 
 
203 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1039  hypothetical protein  42.69 
 
 
204 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2571  hypothetical protein  40.83 
 
 
202 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2837  hypothetical protein  43.48 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.665856  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0886  hypothetical protein  44.64 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0815  hypothetical protein  44.64 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0583  hypothetical protein  41.86 
 
 
180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0402965  normal  0.143572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2116  hypothetical protein  40 
 
 
193 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0491  hypothetical protein  38.32 
 
 
179 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1237  protein of unknown function DUF615  40.45 
 
 
190 aa  99  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2721  hypothetical protein  36.63 
 
 
174 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949713  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0864  hypothetical protein  40.97 
 
 
172 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0352  hypothetical protein  36.36 
 
 
175 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0846  hypothetical protein  41.5 
 
 
179 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512108  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03672  hypothetical protein  36.31 
 
 
174 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01892  hypothetical protein  36.16 
 
 
193 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002396  putative alpha helix protein  35.93 
 
 
175 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2897  hypothetical protein  36.21 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2414  hypothetical protein  39.63 
 
 
182 aa  93.2  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4274  hypothetical protein  41.55 
 
 
173 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.171869  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0941  hypothetical protein  40.85 
 
 
173 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.607933  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0981  hypothetical protein  40.85 
 
 
173 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0511  hypothetical protein  33.92 
 
 
178 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0532  hypothetical protein  33.92 
 
 
178 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.993858  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3068  hypothetical protein  36.42 
 
 
177 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0537  hypothetical protein  33.92 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3806  hypothetical protein  33.92 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0948  hypothetical protein  40.85 
 
 
173 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30655  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0593  hypothetical protein  34.48 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3822  hypothetical protein  36.53 
 
 
182 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0650  protein of unknown function DUF615  34.74 
 
 
215 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0481  hypothetical protein  37.36 
 
 
182 aa  89.4  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.275337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4155  hypothetical protein  40.69 
 
 
173 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4464  hypothetical protein  40.69 
 
 
173 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000293332  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3456  hypothetical protein  32.75 
 
 
177 aa  88.6  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58060  hypothetical protein  39.44 
 
 
200 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0123622  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0494  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3632  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0274  hypothetical protein  34.73 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.649245  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2233  hypothetical protein  41.35 
 
 
175 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305733  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0864  hypothetical protein  35.83 
 
 
182 aa  85.1  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4079  hypothetical protein  31.58 
 
 
177 aa  85.1  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12730  hypothetical protein  39.58 
 
 
172 aa  85.1  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5087  hypothetical protein  39.86 
 
 
174 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0266  hypothetical protein  34.13 
 
 
183 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0022  hypothetical protein  36.6 
 
 
159 aa  82  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2422  hypothetical protein  38.19 
 
 
179 aa  82  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.946472  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2265  protein of unknown function DUF615  41.86 
 
 
165 aa  82  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1560  hypothetical protein  34.55 
 
 
197 aa  82  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4387  hypothetical protein  33.53 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0425  hypothetical protein  33.53 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1170  hypothetical protein  33.53 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0143293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0489  hypothetical protein  33.53 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00272  hypothetical protein  34.68 
 
 
185 aa  81.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2013  hypothetical protein  37.43 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4782  hypothetical protein  34.73 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153029  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4837  hypothetical protein  34.73 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857829  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4687  hypothetical protein  34.73 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.67161  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4719  hypothetical protein  34.73 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.68666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4817  hypothetical protein  34.73 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0021  hypothetical protein  35.53 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1335  hypothetical protein  34.68 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.154229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3664  hypothetical protein  36.03 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1395  hypothetical protein  37.06 
 
 
167 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0421  hypothetical protein  36.26 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1326  hypothetical protein  31.14 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3741  hypothetical protein  36 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3184  hypothetical protein  33.57 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.836007  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3760  protein of unknown function DUF615  33.53 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5753  hypothetical protein  33.53 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3777  hypothetical protein  33.53 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>