119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0650 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0650  protein of unknown function DUF615  100 
 
 
215 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2322  hypothetical protein  39.04 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0300242  normal  0.462605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1222  hypothetical protein  46.02 
 
 
217 aa  95.1  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0970  protein of unknown function DUF615  36.31 
 
 
220 aa  92.8  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12071  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2147  hypothetical protein  36.11 
 
 
176 aa  91.7  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257138  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1384  hypothetical protein  38.38 
 
 
202 aa  92  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00400035  normal  0.0106764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2078  hypothetical protein  34.74 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0910  hypothetical protein  35.35 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2223  hypothetical protein  35.15 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4194  hypothetical protein  34.26 
 
 
204 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1052  hypothetical protein  35.2 
 
 
220 aa  89  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457164  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0780  hypothetical protein  35.71 
 
 
193 aa  89  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912391  normal  0.0586542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2837  hypothetical protein  37.76 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.665856  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0944  hypothetical protein  38.8 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.0275121 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2013  hypothetical protein  34.21 
 
 
186 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2414  hypothetical protein  34.25 
 
 
182 aa  85.9  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2721  hypothetical protein  32.77 
 
 
174 aa  84.7  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949713  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1335  hypothetical protein  35.68 
 
 
179 aa  84.7  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.154229 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2083  protein of unknown function DUF615  41.59 
 
 
175 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.363472  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0956  hypothetical protein  33.5 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4260  hypothetical protein  40.61 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.541148  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2116  hypothetical protein  35.36 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0960  hypothetical protein  33.01 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3288  hypothetical protein  43.59 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2571  hypothetical protein  36.07 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2955  hypothetical protein  32.56 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0601  hypothetical protein  33.51 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1080  hypothetical protein  33.51 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2906  hypothetical protein  32.56 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1039  hypothetical protein  33.51 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2846  hypothetical protein  32.12 
 
 
202 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.913933  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0390  hypothetical protein  32.56 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1395  hypothetical protein  35.36 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2533  hypothetical protein  32.56 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.914076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0906  hypothetical protein  32.56 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0241  hypothetical protein  32.56 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3553  protein of unknown function DUF615  35.83 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0886  hypothetical protein  33.5 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1672  hypothetical protein  32.56 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0421  hypothetical protein  31.84 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0815  hypothetical protein  33.5 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0022  hypothetical protein  39.32 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0596  hypothetical protein  38.94 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1911  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  unclonable  0.00000673903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0583  hypothetical protein  30.27 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0402965  normal  0.143572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2888  hypothetical protein  38.61 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3822  hypothetical protein  32.16 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0274  hypothetical protein  32.96 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.649245  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0473  hypothetical protein  29.15 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.353455  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0413  hypothetical protein  30.15 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.229359  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0021  hypothetical protein  38.46 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1560  hypothetical protein  34.55 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5087  hypothetical protein  32.11 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58060  hypothetical protein  30.85 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0123622  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0425  hypothetical protein  31.28 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0489  hypothetical protein  31.28 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2897  hypothetical protein  30.81 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0537  hypothetical protein  28.21 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0266  hypothetical protein  32.4 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3806  hypothetical protein  28.21 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2966  hypothetical protein  31.32 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119869  normal  0.461919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1018  hypothetical protein  31.32 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2233  hypothetical protein  35.66 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305733  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4782  hypothetical protein  30.73 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153029  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4837  hypothetical protein  30.73 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857829  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4687  hypothetical protein  30.73 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.67161  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4719  hypothetical protein  30.73 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.68666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4817  hypothetical protein  30.73 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03672  hypothetical protein  40.52 
 
 
174 aa  72  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04102  hypothetical protein  29.61 
 
 
183 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3760  protein of unknown function DUF615  29.61 
 
 
183 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0941  hypothetical protein  30.94 
 
 
173 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.607933  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04066  hypothetical protein  29.61 
 
 
183 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0593  hypothetical protein  28.21 
 
 
178 aa  72  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0981  hypothetical protein  30.94 
 
 
173 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4487  hypothetical protein  29.61 
 
 
183 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4804  hypothetical protein  29.61 
 
 
183 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1170  hypothetical protein  30.73 
 
 
182 aa  72  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0143293 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3777  hypothetical protein  29.61 
 
 
183 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4712  hypothetical protein  29.61 
 
 
183 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5753  hypothetical protein  29.61 
 
 
183 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4850  hypothetical protein  29.61 
 
 
183 aa  72  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12730  hypothetical protein  31.87 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0481  hypothetical protein  36.57 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.275337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4387  hypothetical protein  31.84 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3664  hypothetical protein  31.84 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4274  hypothetical protein  29.28 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.171869  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2265  protein of unknown function DUF615  41.91 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002396  putative alpha helix protein  37.93 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0511  hypothetical protein  27.69 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0532  hypothetical protein  27.69 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.993858  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01892  hypothetical protein  30.69 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0948  hypothetical protein  29.47 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30655  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0491  hypothetical protein  31.69 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0864  hypothetical protein  32.2 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0846  hypothetical protein  29.53 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512108  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0494  hypothetical protein  27.32 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3632  hypothetical protein  27.32 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3456  hypothetical protein  27.32 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1238  hypothetical protein  25.26 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>