122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2265 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2265  protein of unknown function DUF615  100 
 
 		 165 aa  322  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1911  hypothetical protein  47.65 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  unclonable  0.00000673903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0583  hypothetical protein  42.11 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0402965  normal  0.143572 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2147  hypothetical protein  45.45 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257138  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3288  hypothetical protein  41.4 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0481  hypothetical protein  41.61 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.275337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1384  hypothetical protein  46.92 
 
 		 202 aa  104  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00400035  normal  0.0106764 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3068  hypothetical protein  40.12 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0494  hypothetical protein  36.31 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3632  hypothetical protein  36.31 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3456  hypothetical protein  36.31 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3722  hypothetical protein  38.85 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000177503  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2837  hypothetical protein  43.11 
 
 		 208 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.665856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1222  hypothetical protein  44.12 
 
 		 217 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0022  hypothetical protein  39.22 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2233  hypothetical protein  39.75 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305733  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58060  hypothetical protein  38.92 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0123622  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4079  hypothetical protein  35.03 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0021  hypothetical protein  39.22 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5087  hypothetical protein  38.32 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3184  hypothetical protein  37.8 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0593  hypothetical protein  36.08 
 
 		 178 aa  94.7  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0948  hypothetical protein  38.31 
 
 		 173 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0944  hypothetical protein  39.51 
 
 		 208 aa  94  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.0275121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0864  hypothetical protein  41.1 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3806  hypothetical protein  35.44 
 
 		 178 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0537  hypothetical protein  35.44 
 
 		 178 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1238  hypothetical protein  35.67 
 
 		 181 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0511  hypothetical protein  35.44 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0532  hypothetical protein  35.44 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.993858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0941  hypothetical protein  37.66 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.607933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12730  hypothetical protein  38.65 
 
 		 172 aa  91.7  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0981  hypothetical protein  37.66 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4387  hypothetical protein  38.22 
 
 		 182 aa  91.7  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0886  hypothetical protein  37.04 
 
 		 208 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0864  hypothetical protein  40.38 
 
 		 172 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0815  hypothetical protein  37.04 
 
 		 208 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1170  hypothetical protein  36.88 
 
 		 182 aa  90.5  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0143293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2571  hypothetical protein  38.12 
 
 		 202 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0425  hypothetical protein  36.88 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0489  hypothetical protein  36.88 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4274  hypothetical protein  36.81 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.171869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2888  hypothetical protein  37.27 
 
 		 204 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3553  protein of unknown function DUF615  37.27 
 
 		 218 aa  89.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2013  hypothetical protein  37.82 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1560  hypothetical protein  42.77 
 
 		 197 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0970  protein of unknown function DUF615  42.03 
 
 		 220 aa  88.2  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1052  hypothetical protein  42.03 
 
 		 220 aa  88.2  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2116  hypothetical protein  39.22 
 
 		 193 aa  88.2  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1326  hypothetical protein  33.74 
 
 		 177 aa  87.8  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1237  protein of unknown function DUF615  42.28 
 
 		 190 aa  87.4  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002396  putative alpha helix protein  40.13 
 
 		 175 aa  87.4  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00272  hypothetical protein  35 
 
 		 185 aa  87.4  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0910  hypothetical protein  41.13 
 
 		 203 aa  87.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3664  hypothetical protein  37.5 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1131  hypothetical protein  35.71 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0187042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4260  hypothetical protein  37.84 
 
 		 236 aa  86.3  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.541148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4194  hypothetical protein  38.32 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2422  hypothetical protein  36.97 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.946472  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3822  hypothetical protein  36.65 
 
 		 182 aa  85.1  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2322  hypothetical protein  39.57 
 
 		 225 aa  85.1  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0300242  normal  0.462605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4719  hypothetical protein  35.95 
 
 		 183 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.68666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4817  hypothetical protein  35.95 
 
 		 183 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2078  hypothetical protein  41.73 
 
 		 220 aa  84.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0421  hypothetical protein  35.29 
 
 		 183 aa  84.7  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4782  hypothetical protein  35.95 
 
 		 183 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4837  hypothetical protein  35.95 
 
 		 183 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4687  hypothetical protein  35.95 
 
 		 183 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.67161  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03672  hypothetical protein  39.07 
 
 		 174 aa  84  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2083  protein of unknown function DUF615  38.93 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.363472  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3741  hypothetical protein  37.65 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0780  hypothetical protein  35.12 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912391  normal  0.0586542 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2414  hypothetical protein  38 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0192  hypothetical protein  35.9 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0148149  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04102  hypothetical protein  34.64 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3760  protein of unknown function DUF615  34.64 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5753  hypothetical protein  34.64 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04066  hypothetical protein  34.64 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4487  hypothetical protein  34.64 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4804  hypothetical protein  34.64 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3777  hypothetical protein  34.64 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4712  hypothetical protein  34.64 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4850  hypothetical protein  34.64 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4155  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0601  hypothetical protein  37.13 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1080  hypothetical protein  37.13 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1039  hypothetical protein  37.13 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2897  hypothetical protein  38.71 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4464  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000293332  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1395  hypothetical protein  38.22 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284813  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0571  hypothetical protein  32.92 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.310055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0596  hypothetical protein  36.47 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2721  hypothetical protein  35.53 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0266  hypothetical protein  33.99 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0274  hypothetical protein  33.99 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.649245  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0846  hypothetical protein  35.26 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512108  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0413  hypothetical protein  37.5 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.229359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01892  hypothetical protein  39.26 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0956  hypothetical protein  36.81 
 
 		 203 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0473  hypothetical protein  37.5 
 
 		 189 aa  77.4  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.353455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>