121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4387 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4387  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  357  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0425  hypothetical protein  88.27 
 
 
182 aa  318  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0489  hypothetical protein  88.27 
 
 
182 aa  318  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1170  hypothetical protein  87.71 
 
 
182 aa  317  5e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0143293 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3664  hypothetical protein  83.61 
 
 
183 aa  301  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3822  hypothetical protein  83.98 
 
 
182 aa  299  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0266  hypothetical protein  83.61 
 
 
183 aa  291  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0274  hypothetical protein  83.43 
 
 
183 aa  286  9e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.649245  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4850  hypothetical protein  77.6 
 
 
183 aa  262  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04102  hypothetical protein  77.9 
 
 
183 aa  261  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3760  protein of unknown function DUF615  77.9 
 
 
183 aa  261  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04066  hypothetical protein  77.9 
 
 
183 aa  261  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5753  hypothetical protein  77.9 
 
 
183 aa  261  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4487  hypothetical protein  77.9 
 
 
183 aa  261  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4804  hypothetical protein  77.9 
 
 
183 aa  261  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3777  hypothetical protein  77.9 
 
 
183 aa  261  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4712  hypothetical protein  77.9 
 
 
183 aa  261  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4817  hypothetical protein  78.45 
 
 
183 aa  261  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4782  hypothetical protein  78.45 
 
 
183 aa  261  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153029  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4837  hypothetical protein  78.45 
 
 
183 aa  261  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857829  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4687  hypothetical protein  78.45 
 
 
183 aa  261  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.67161  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4719  hypothetical protein  78.45 
 
 
183 aa  261  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.68666  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0421  hypothetical protein  76.24 
 
 
183 aa  258  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1326  hypothetical protein  62.73 
 
 
177 aa  201  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002396  putative alpha helix protein  62.96 
 
 
175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03672  hypothetical protein  60.49 
 
 
174 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2116  hypothetical protein  59.6 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0491  hypothetical protein  53.29 
 
 
179 aa  155  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1131  hypothetical protein  52.9 
 
 
168 aa  148  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0187042  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0192  hypothetical protein  49.08 
 
 
175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0148149  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00272  hypothetical protein  45.45 
 
 
185 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2013  hypothetical protein  47.13 
 
 
186 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0864  hypothetical protein  43.9 
 
 
172 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0494  hypothetical protein  44.24 
 
 
177 aa  131  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3632  hypothetical protein  44.24 
 
 
177 aa  131  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58060  hypothetical protein  43.1 
 
 
200 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0123622  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1560  hypothetical protein  48.75 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0941  hypothetical protein  44.16 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.607933  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0981  hypothetical protein  44.16 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3456  hypothetical protein  43.64 
 
 
177 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5087  hypothetical protein  45.81 
 
 
174 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0948  hypothetical protein  43.51 
 
 
173 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30655  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4079  hypothetical protein  43.14 
 
 
177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0593  hypothetical protein  43.03 
 
 
178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4274  hypothetical protein  42.86 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.171869  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0537  hypothetical protein  42.42 
 
 
178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3806  hypothetical protein  42.42 
 
 
178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4552  hypothetical protein  39.61 
 
 
174 aa  124  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3068  hypothetical protein  44.3 
 
 
177 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0481  hypothetical protein  45.03 
 
 
182 aa  123  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.275337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0846  hypothetical protein  46.79 
 
 
179 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512108  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0511  hypothetical protein  41.82 
 
 
178 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0532  hypothetical protein  41.82 
 
 
178 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.993858  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12730  hypothetical protein  42.58 
 
 
172 aa  121  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1238  hypothetical protein  43.51 
 
 
181 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001561  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2897  hypothetical protein  44.24 
 
 
196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2147  hypothetical protein  45.7 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257138  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0583  hypothetical protein  37.5 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0402965  normal  0.143572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4155  hypothetical protein  45.81 
 
 
173 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4464  hypothetical protein  45.81 
 
 
173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000293332  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01892  hypothetical protein  41.32 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0021  hypothetical protein  40.52 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3722  hypothetical protein  39.87 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000177503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2233  hypothetical protein  37.06 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305733  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0390  hypothetical protein  38.99 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2571  hypothetical protein  39.29 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2533  hypothetical protein  38.99 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.914076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0906  hypothetical protein  38.99 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0241  hypothetical protein  38.99 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0886  hypothetical protein  42.26 
 
 
208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0815  hypothetical protein  42.26 
 
 
208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0944  hypothetical protein  41.67 
 
 
208 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.0275121 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0022  hypothetical protein  39.87 
 
 
159 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2955  hypothetical protein  38.99 
 
 
202 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2906  hypothetical protein  38.99 
 
 
199 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1911  hypothetical protein  43.14 
 
 
161 aa  111  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  unclonable  0.00000673903 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2846  hypothetical protein  39.87 
 
 
202 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.913933  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2223  hypothetical protein  39.24 
 
 
203 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0352  hypothetical protein  41.67 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1335  hypothetical protein  37.43 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.154229 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0864  hypothetical protein  38.73 
 
 
182 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1672  hypothetical protein  37.11 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1237  protein of unknown function DUF615  38.92 
 
 
190 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0596  hypothetical protein  41.45 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4194  hypothetical protein  38.36 
 
 
204 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0956  hypothetical protein  38.61 
 
 
203 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0960  hypothetical protein  38.61 
 
 
200 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0601  hypothetical protein  38.32 
 
 
203 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1080  hypothetical protein  38.32 
 
 
203 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1039  hypothetical protein  38.32 
 
 
204 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3184  hypothetical protein  36.31 
 
 
178 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.836007  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1018  hypothetical protein  36.36 
 
 
203 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2414  hypothetical protein  39.31 
 
 
182 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31383  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0780  hypothetical protein  38.31 
 
 
193 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912391  normal  0.0586542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2966  hypothetical protein  36.36 
 
 
204 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119869  normal  0.461919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0910  hypothetical protein  38.56 
 
 
203 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2721  hypothetical protein  39.24 
 
 
174 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949713  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0473  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  94.4  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.353455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2888  hypothetical protein  38.12 
 
 
204 aa  93.6  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0413  hypothetical protein  32.76 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.229359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>